NGC 4725 (UGC 7989)

Галактика найдена из пересечения HYPERLEDA и https://arxiv.org/pdf/1608.06735v1.pdf.


In [1]:
from IPython.display import HTML
from IPython.display import Image
import os

%pylab
%matplotlib inline
%run ../../../utils/load_notebook.py


Using matplotlib backend: Qt4Agg
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [2]:
from photometry import *


importing Jupyter notebook from photometry.ipynb
Using matplotlib backend: Qt4Agg
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [3]:
from instabilities import *


importing Jupyter notebook from instabilities.ipynb
Using matplotlib backend: Qt4Agg
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [4]:
from utils import *


importing Jupyter notebook from utils.ipynb

In [5]:
name = 'N4725'
gtype = 'SABa' #LEDA, 'SBbc' from Heraudeau98
incl = 45.4  #LEDA
scale = 0.098 #kpc/arcsec according to NED

data_path = '../../../data/n4725_u7989'
sin_i, cos_i = np.sin(incl*np.pi/180.), np.cos(incl*np.pi/180.)

In [6]:
%%javascript 
$.getScript('https://kmahelona.github.io/ipython_notebook_goodies/ipython_notebook_toc.js')


Оглавление

Статьи

TODO: add arcticles

Разное


In [7]:
os.chdir(data_path)

# Данные из NED
HTML('<iframe src=http://ned.ipac.caltech.edu/cgi-bin/objsearch?objname=ngc+4725&extend=no&hconst=\
73&omegam=0.27&omegav=0.73&corr_z=1&out_csys=Equatorial&out_equinox=J2000.0&obj_sort=RA+or+Longitude&of=pre_text&zv_breaker=\
30000.0&list_limit=5&img_stamp=YES width=1000 height=350></iframe>')


Out[7]:

In [8]:
# Данные из HYPERLEDA
HTML('<iframe src=http://leda.univ-lyon1.fr/ledacat.cgi?o=ngc4725 width=1000 height=350></iframe>')


Out[8]:

In [9]:
#SDSS
Image('n4725_SDSS.jpg', width=500)


Out[9]:

Проблема в том, что эта галактика есть в DR7, но в более поздних релихах я не смог ее найти, соответственно не знаю масштаба корректного.

Однако я понял, что сама картинка из выборки http://cosmo.nyu.edu/hogg/rc3/ и там есть с маштабом изображение:


In [10]:
Image('n4725_SDSS_labeled.jpg', width=500)


Out[10]:

In [11]:
#JHK
Image('n4725_2MASS.jpg', width=300)


Out[11]:

In [12]:
Image('noord_p113_cite.png')


Out[12]:

Кинематические данные по звездам

Дисперсии скоростей и кривая вращения - есть в Heraudeau 1999 http://adsabs.harvard.edu/cgi-bin/bib_query?1999A%26AS..136..509H до ~50'' (1 разрез), PA=$35^{\circ}$

TODO: понять, исправлено ли за наклон

Кривая вращения


In [13]:
# Данные по звездной кинематике Heraudeau+1999 вдоль большой полуоси (не исправленные за наклон?) - из HYPERLEDA
r_ma, vel_ma, e_vel_ma, sig_ma, e_sig_ma = zip(*np.loadtxt("her99_kinem.dat", float))

fig = plt.figure(figsize=[8,5])
plt.errorbar(r_ma, vel_ma, e_vel_ma, fmt='.', marker='.', mew=0, label="Heraudeau 1998 stars maj")
plt.legend()
plt.ylim(-350., 350.)
plt.show()



In [14]:
Image('her99_rot.png') #оригинал


Out[14]:

Приближение:


In [15]:
r_ma_b, vel_ma_b, e_vel_b = zip(*sorted(zip(np.abs(r_ma), np.abs(vel_ma), e_vel_ma)))

In [16]:
fig = plt.figure(figsize=[8,4])
plt.errorbar(r_ma_b, vel_ma_b, yerr=e_vel_b, fmt='.', marker='.', mew=0, color='blue', label = 'Her98 star maj')

test_points = np.linspace(0.0, max(r_ma_b), 100)

poly_star = poly1d(polyfit(r_ma_b, vel_ma_b, deg=7))
plt.plot(test_points, poly_star(test_points), '-', label='poly deg=7')

def w(arr):
    return map(lambda l: 1/(1. + l**2), arr)

import scipy.interpolate as inter

spl = inter.UnivariateSpline(r_ma_b, vel_ma_b, k=3, s=10000., w=w(e_vel_b))
plt.plot(test_points, spl(test_points), '-', label='spl s=10000 w^2')

spl = inter.UnivariateSpline(r_ma_b, vel_ma_b, k=3, s=10000.)
plt.plot(test_points, spl(test_points), '-', label='spl s=10000')

plt.legend(loc='upper left')
plt.ylim(0, 170)
plt.show()


C весами плохо получается, полином и обычный почти совпадают - берем их:


In [17]:
star_approx = spl

Дисперсии


In [18]:
r_sig_ma = r_ma #Heraudeau+1999

fig = plt.figure(figsize=[6., 4.])
plt.errorbar(r_sig_ma, sig_ma, yerr=e_sig_ma, fmt='.', marker='.', mew=0, color='blue', label=r'$maj\, Heraudeau $')

plt.xlabel('$R$')
plt.ylabel('$\sigma$')
plt.ylim(0, 350)
plt.legend();



In [19]:
Image('her99_disp.png') #из статьи


Out[19]:

In [20]:
fig = plt.figure(figsize=[6., 4.])
plt.errorbar(map(abs, r_sig_ma), sig_ma, yerr=e_sig_ma, fmt='.', marker='.', mew=0, color='blue', label=r'$maj\, Heraudeau $')
plt.xlabel('$R$')
plt.ylabel('$\sigma$')
plt.ylim(0, 250)
plt.legend();


Для большой оси: $\sigma^2_{maj} = \sigma^2_{\varphi}\sin^2 i + \sigma^2_{z}\cos^2 i$, следовательно примерные ограничения $$\sigma_{maj} < \frac{\sigma_{maj}}{\sqrt{\sin^2 i + 0.49\cos^2 i}}< \sigma_R = \frac{\sigma_{maj}}{\sqrt{f\sin^2 i + \alpha^2\cos^2 i}} ~< \frac{\sigma_{maj}}{\sqrt{0.5\sin^2 i + 0.09\cos^2 i}} < \frac{\sqrt{2}\sigma_{maj}}{\sin i} (или \frac{\sigma_{maj}}{\sqrt{f}\sin i}),$$ или можно более точную оценку дать, если построить $f$ (сейчас $0.5 < f < 1$).

Для малой оси: $\sigma^2_{min} = \sigma^2_{R}\sin^2 i + \sigma^2_{z}\cos^2 i$ и ограничения $$\sigma_{min} < \frac{\sigma_{min}}{\sqrt{\sin^2 i + 0.49\cos^2 i}} < \sigma_R = \frac{\sigma_{min}}{\sqrt{\sin^2 i + \alpha^2\cos^2 i}} ~< \frac{\sigma_{min}}{\sqrt{\sin^2 i + 0.09\cos^2 i}} < \frac{\sigma_{min}}{\sin i}$$

Соответственно имеем 5 оценок из maj и 4 оценки из min.

У нас только большая ось - все оценки из нее:


In [21]:
spl_maj = inter.UnivariateSpline(r_sig_ma, sig_ma, k=3, s=10000.)
sig_maj_lim = max(r_sig_ma)

points = np.linspace(0.1, max(r_ma)+15., 100)

In [22]:
# TODO: move to external file

def flat_end(argument):
    '''декоратор для того, чтобы продолжать функцию на уровне последнего значения'''
    def real_decorator(function):
        def wrapper(*args, **kwargs):
            if args[0] < argument:
                return function(*args, **kwargs)
            else:
                return function(argument, *args[1:], **kwargs)
        return wrapper
    return real_decorator

@flat_end(sig_maj_lim)
def sig_R_maj_minmin(r, spl_maj=spl_maj):
    return spl_maj(r).item()

@flat_end(sig_maj_lim)
def sig_R_maj_min(r, spl_maj=spl_maj):
    return spl_maj(r).item()/sqrt(sin_i**2 + 0.49*cos_i**2)
    
@flat_end(sig_maj_lim)
def sig_R_maj_max(r, spl_maj=spl_maj):
    return spl_maj(r).item()/sqrt(0.5*sin_i**2 + 0.09*cos_i**2)

@flat_end(sig_maj_lim)
def sig_R_maj_maxmax(r, spl_maj=spl_maj):
    return spl_maj(r)*sqrt(2)/sin_i
    
@flat_end(sig_maj_lim)
def sig_R_maj_maxmaxtrue(r, spl_maj=spl_maj):
    return spl_maj(r)/sin_i/sqrt(sigPhi_to_sigR_real(r))

Используем соотношение $\sigma_{\varphi}^{2}/\sigma_{R}^{2}$, которое описывается уравнением ${\displaystyle \sigma_{\varphi}^{2}/\sigma_{R}^{2}=0.5\left(1+\frac{R}{\bar{v}_{\varphi}}\frac{d\bar{v}_{\varphi}}{dR}\right)}$ (Binney & Tremaine, 1987)


In [23]:
def sigPhi_to_sigR_real(R):
        return 0.5 * (1 + R*star_approx.derivative()(R) / star_approx(R))

plt.plot(test_points, [sigPhi_to_sigR_real(R) for R in test_points], 'd-', color='green')
plt.axhline(y=0.5)
plt.axhline(y=0.0)
plt.xlabel('$R$')
plt.ylabel(r"$\sigma_{\varphi}^2/\sigma_{R}^2$")
plt.ylim(0);


Т.к. насчет малой оси я не уверен - приближения делаем по большой.


In [24]:
plt.errorbar(r_sig_ma, sig_ma, yerr=e_sig_ma, fmt='.', marker='.', mew=0, color='red', label='$\sigma_{los}^{maj}$')
plt.plot(points, map(sig_R_maj_minmin, points), label = 'minmin')
plt.plot(points, map(sig_R_maj_min, points), label = 'min')
plt.plot(points, map(sig_R_maj_max, points), label = 'max')
plt.plot(points, map(sig_R_maj_maxmax, points), label = 'maxmax')
plt.plot(points, map(sig_R_maj_maxmaxtrue, points), label = 'maxmaxtrue')

plt.legend()
plt.ylim(0,400)
plt.xlim(0,80);


Видно, что настоящее еще и больше.

Данные по газу

Кривая вращения


In [25]:
Image('HI_rot.png') #HI WHISP from van Eymeren 2011, PA=32.45, R25=25.91kpc, разные цвета - это две стороны, черная - усредненная


Out[25]:

Достаточно странно расположились черные точки - не между двумя другими, выглядит неверным


In [26]:
R25 = 25.91

# Данные по кинематике газа van Eymeren 2011 в HI
r_hi, vel_hi = zip(*np.loadtxt("HI_rot.dat", float, delimiter=','))
plt.plot(r_hi, vel_hi, 'd', label='HI Eymeren+2011')
plt.ylim(0, 300)
plt.xlim(-0.5, 2.)


Out[26]:
(-0.5, 2.0)

Из Ноордермеера:


In [27]:
Image('noord_rot.png')


Out[27]:

In [28]:
# Данные по кинематике газа van Eymeren 2011 в HI
r_n, vel_n = zip(*np.loadtxt("noord_rot.dat", float, delimiter=','))
plt.plot(r_n, vel_n, 'd', label='HI Noord+2005')
plt.ylim(850, 1550)
plt.xlim(-10., 11.)


Out[28]:
(-10.0, 11.0)

In [29]:
vel_n = map(lambda l: l-1208., vel_n)
r_n, vel_n = zip(*sorted(zip(np.abs(r_n), np.abs(vel_n))))
r_n = [l*60 for l in r_n]

Посмотрим на согласие между измерениями:


In [30]:
plt.plot(r_n, vel_n, 'd', label='HI Noord+2005')
plt.plot([l*R25/scale for l in r_hi], vel_hi, 'd', label='HI Eymeren+2011')
plt.legend();


Похоже, что у Ноордермеера не нормировано на угол. Проверим:


In [31]:
plt.plot(r_n, [l/sin_i for l in vel_n], 'd', label='HI Noord+2005')
plt.plot([l*R25/scale for l in r_hi], vel_hi, 'd', label='HI Eymeren+2011')
plt.legend(loc='lower right');


Да, так и есть - данные хорошо совпали для исправленных за угол измерений Ноордермеера (даже для такой низкой точности снятия данных с рисунка). Странно, что у более новых данных протяженность значительно меньше. Для построения кривой возьмем более оба набора до $200^{''}$:


In [32]:
r_hi = [l*R25/scale for l in r_hi]
vel_n = [l/sin_i for l in vel_n]

In [33]:
fig = plt.figure(figsize=[10,6])
_1,_2, = [0.0,],[0.0,]
_1.extend(r_hi)
_2.extend(vel_hi)
_1,_2 = zip(*sorted(zip(_1,_2)))

gas_approx = poly1d(polyfit(_1, _2, deg=9))
test_points = np.linspace(0, max(r_hi), 100)
plt.plot(test_points, gas_approx(test_points), '--', label='poly approx')

spl_gas = inter.UnivariateSpline(_1, _2, k=3, s=2000.)
plt.plot(test_points, spl_gas(test_points), '-', label='spline')

plt.plot(r_hi, vel_hi, 'd', label='HI Eymeren+2011')

gas_approx = poly1d(polyfit(r_n[:-20], vel_n[:-20], deg=9))
plt.plot(test_points, gas_approx(test_points), '--', label='poly approx N')

spl_gas = inter.UnivariateSpline(r_n[:-20], vel_n[:-20], k=3, s=10000.)
plt.plot(test_points, spl_gas(test_points), '-', label='spline N')

plt.plot(r_n[:-20], vel_n[:-20], 'v', label='HI Noord+2005')


plt.ylim(0, 300)
plt.legend(loc='lower right');


Похоже для данных Eymeren вторая точка все портит и вообще точность в нужной нам области хромает.


In [34]:
fig = plt.figure(figsize=[10,6])
_1,_2, = [0.0,],[0.0,]
_1.extend(r_hi[1:])
_2.extend(vel_hi[1:])
_1,_2 = zip(*sorted(zip(_1,_2)))

gas_approx = poly1d(polyfit(_1, _2, deg=9))
test_points = np.linspace(0, max(r_hi), 100)
plt.plot(test_points, gas_approx(test_points), '--', label='poly approx')

spl_gas = inter.UnivariateSpline(_1, _2, k=3, s=2000.)
plt.plot(test_points, spl_gas(test_points), '-', label='spline')

plt.plot(_1, _2, 'd', label='HI Eymeren+2011')

gas_approx = poly1d(polyfit(r_n[:-20], vel_n[:-20], deg=9))
plt.plot(test_points, gas_approx(test_points), '--', label='poly approx N')

spl_gas_N = inter.UnivariateSpline(r_n[:-20], vel_n[:-20], k=3, s=10000.)
plt.plot(test_points, spl_gas_N(test_points), '-', label='spline N')

plt.plot(r_n[:-20], vel_n[:-20], 'v', label='HI Noord+2005')


plt.ylim(0, 300)
plt.legend(loc='lower right');


Если убрать эту точку - то сплайны почти совпадают, но все равно точность недостаточная.

TODO: поискать более точные данные - например CO

Эпициклическая частота

Для случая бесконечного тонкого диска: $$\kappa=\frac{3}{R}\frac{d\Phi}{dR}+\frac{d^2\Phi}{dR^2}$$ где $\Phi$ - гравпотенциал, однако его знать не надо, т.к. есть проще формула: $$\kappa=\sqrt{2}\frac{\vartheta_c}{R}\sqrt{1+\frac{R}{\vartheta_c}\frac{d\vartheta_c}{dR}}$$


In [35]:
test_points = np.linspace(0, 350, 1000)
fig = plt.figure(figsize=[8, 4])
plt.plot(test_points, [epicyclicFreq_real(gas_approx, x, scale) for x in test_points], '-', label='poly')
plt.plot(test_points, [epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in test_points], '-', label='spline')
plt.plot(test_points, [epicyclicFreq_real(spl_gas_N, x, scale) for x in test_points], '-', label='spline N')
plt.xlabel('$R, arcsec$')
plt.ylabel('$\kappa,\, km/s/kpc$', fontsize=15)
plt.ylim(0, 300)
plt.legend();


Достаточно сложно, учитывая что нас интересуют первые 50 секунд. Будем считать, что нас интересуют сплайны.

Поверхностная плотность газа

(необходимо иметь в виду, что в первой работе общий профиль исправлен за гелий следующим образом $\Sigma_g = 1.36\times(\Sigma_{H_2} + \Sigma_{HI})$ и переход CO-to-H2 тоже конкретный)


In [36]:
Image('u7989_gas_dens.png')


Out[36]:

In [37]:
r_g_dens, gas_dens = zip(*np.loadtxt("gas_dens.dat", float, delimiter=','))

plt.semilogy([l/scale for l in r_g_dens[:58]], gas_dens[:58], 'o', color='blue')
plt.semilogy([l/scale for l in r_g_dens[58:77]], gas_dens[58:77], 'o', color='red')
plt.semilogy([l/scale for l in r_g_dens[77:]], gas_dens[77:], 'o', color='black')
plt.ylim(0.01, 1000);



In [38]:
plt.semilogy([l/scale for l in r_g_dens[77:]], gas_dens[77:], 'o');



In [39]:
plt.plot([l/scale for l in r_g_dens[58:77]], gas_dens[58:77], '-o', color='r')
plt.plot([l/scale for l in r_g_dens[77:]], gas_dens[77:], '-o') #только сумма
plt.xlim(0, 200);


Ноордермеер:


In [40]:
Image('noord_gdens.png')


Out[40]:

In [41]:
r_g_n, gas_dens_n = zip(*np.loadtxt("HI_dens.dat", float, delimiter=','))

In [42]:
plt.plot(r_g_n, gas_dens_n, 'o')
plt.xlim(0, 450)
plt.ylim(0, 5)


Out[42]:
(0, 5)

Сравнение:


In [43]:
plt.semilogy([l/scale for l in r_g_dens[:58]], gas_dens[:58], 'o', color='blue', label='Hulst 2016')
plt.semilogy(r_g_n, gas_dens_n, 's', label='Noord HI', color='red')
plt.legend()


Out[43]:
<matplotlib.legend.Legend at 0xeec4ba8>

Как и было изначально видно - пики заметно смещены.

Разгадка кроется, кмк, в том что в работе 2016 года расстояние взято равным 26.8 Мпк, а в NED это соответствует (Virgo + GA + Shapley) и масштаб 0.130 kpc/arcseс.

Также это подтерждается сравнением с верхней шкалой на рисунке, где $R/R_{25}$, $R_{25}=321.^{"}$ и примерно по соотношенияю можно оценить

$$20.5\,kpc/(0.5*321)\,arcsec = 0.1308\, kpc/arcsec$$

In [44]:
plt.semilogy([l/0.130 for l in r_g_dens[:58]], gas_dens[:58], 'o', color='blue', label='Hulst 2016')
plt.semilogy(r_g_n, gas_dens_n, 's', label='Noord HI', color='red')
plt.legend();


И теперь с учетом спирали они стали похожи друг на друга.

Используем более современный газ $\rm{HI}$ + $\rm{HII}$:


In [45]:
r_HI_dens, HI_dens = [l/0.130 for l in r_g_dens[:58]], gas_dens[:58]
r_mol_dens, mol_dens = [l/0.130 for l in r_g_dens[58:77]], gas_dens[58:77]
r_g_dens, gas_dens = [l/0.130 for l in r_g_dens[77:]], gas_dens[77:] #используем только полный газ

Последнее - проверим, что действительно исправлялось как сказанно в работе - домножением на 1.36 суммы газов (а заодно сравним, что если мы будем домножать только атомарный водород):


In [46]:
from scipy.interpolate import interp1d

tmp1_ = interp1d(r_HI_dens, HI_dens)

for r_, d_ in zip(r_mol_dens, mol_dens):
    plt.scatter(r_, 1.36*(d_ + tmp1_(r_)), color='b')
    plt.scatter(r_, 1.36*d_ + tmp1_(r_), color='m')
    
plt.plot(r_g_dens, gas_dens, '-')
plt.ylim(0, 20)
plt.xlim(0, 200);


Да, действительно домножается сумма и в принципе расхождение не такое большое.

Данные по фотометрии


In [47]:
all_photometry = []

S4G данные из GALFIT (есть бар в модели!):


In [48]:
r_eff_s4g = 10.14
# mu_eff_s4g = ...
n_s4g = 2.212
mu0d_s4g = 20.337
h_disc_s4g = 73.20

Тут нужно учитывать, что эти параметры в AB-mag и нуждаются в доп. исправлении.


In [49]:
M_to_L_s4g = s4g_mass_to_light(-21.762, -21.267)
M_to_L_s4g


Out[49]:
0.67889873586113669

In [50]:
p_ = np.arange(0.1, 200., 0.1)

surf_s4g = [s4g_surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_s4g, h=h_disc_s4g), M_to_L_s4g) for l in p_]
plt.plot(p_, surf_s4g, '-', label='S4G [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_s4g))
plt.legend();


Достаточно маленькие.


In [51]:
all_photometry.append(('S4G 3.6', r_eff_s4g, None, n_s4g, mu0d_s4g, h_disc_s4g, M_to_L_s4g, 
                       lambda l: s4g_surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_s4g, h=h_disc_s4g), M_to_L_s4g)))

In [52]:
mu0d_J = 17.78
h_disc_J = 49.99
mu0d_H = 17.11
h_disc_H = 50.28
mu0d_K = 17.01
h_disc_K = 54.66

In [53]:
b_v_color = 0.012 #TODO: не знаем на самом деле какой цвет (вот тут https://arxiv.org/pdf/1102.1724v1.pdf указано 0.012)
# тут https://arxiv.org/pdf/astro-ph/0610688v2.pdf есть B и V в Янских

M_to_L_J = bell_mass_to_light(b_v_color, 'J', 'B-V')
surf_J = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_J, h=h_disc_J), M_to_L=M_to_L_J, band='J') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_J, '-', label='J [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_J))

M_to_L_H = bell_mass_to_light(b_v_color, 'H', 'B-V')
surf_H = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_H, h=h_disc_H), M_to_L=M_to_L_H, band='H') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_H, '-', label='H [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_H))

M_to_L_K = bell_mass_to_light(b_v_color, 'K', 'B-V')
surf_K = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K), M_to_L=M_to_L_K, band='K') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_K, '-', label='K [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_K))

plt.legend()


Out[53]:
<matplotlib.legend.Legend at 0xf2058d0>

In [54]:
p_ = np.arange(0.1, 200., 0.1)

b_r_color = 0.55 #вот отсюда древнее B-R https://ui.adsabs.harvard.edu/#abs/1995AJ....109..543B/abstract

M_to_L_J = bell_mass_to_light(b_r_color, 'J', 'B-R')
surf_J = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_J, h=h_disc_J), M_to_L=M_to_L_J, band='J') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_J, '-', label='J [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_J))

M_to_L_H = bell_mass_to_light(b_r_color, 'H', 'B-R')
surf_H = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_H, h=h_disc_H), M_to_L=M_to_L_H, band='H') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_H, '-', label='H [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_H))

M_to_L_K = bell_mass_to_light(b_r_color, 'K', 'B-R')
surf_K = [surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K), M_to_L=M_to_L_K, band='K') for l in p_]
plt.plot(p_, surf_K, '-', label='K [M/L={:2.2f}]'.format(M_to_L_K))

plt.legend()


Out[54]:
<matplotlib.legend.Legend at 0xe6d2da0>

Разница, как мы видим, не столь существенная.

TODO: разобраться с цветом


In [55]:
all_photometry.append(('Heidt J', None, None, None, mu0d_J, h_disc_J, M_to_L_J, 
                       lambda l: surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_J, h=h_disc_J), M_to_L=M_to_L_J, band='J')))

all_photometry.append(('Heidt H', None, None, None, mu0d_H, h_disc_H, M_to_L_H, 
                       lambda l: surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_H, h=h_disc_H), M_to_L=M_to_L_H, band='H')))

all_photometry.append(('Heidt K', None, None, None, mu0d_K, h_disc_K, M_to_L_K, 
                       lambda l: surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K), M_to_L=M_to_L_K, band='K')))

In [56]:
# for 3.6 band
dist_36 =  13.24 #Mpc
r_eff_36 = np.power(10., 3.)/scale/1000./(dist_36/20.4) #pc
mu_eff_36 = 17.49
n_36 = 3.61
mu0d_36 = 19.65
h_disc_36 = np.power(10., 3.66)/scale/1000./(dist_36/20.4) #because original is Log(), pc

Опять же, надо исправлять.


In [57]:
surf_36 = [s4g_surf_density(mu=m, M_to_L=M_to_L_s4g) for m in [mu_disc(l, mu0=mu0d_36, h=h_disc_36) for l in p_]]

plt.plot(p_, surf_36, '-', label='3.6 [M/L={:2.2f}]'.format(0.6))
plt.legend()


Out[57]:
<matplotlib.legend.Legend at 0x104fe160>

Вполне неплохо. Можем сравнить еще с калибровками McGaugh:


In [58]:
bv_color = 0.9
mcgaugh_mass_to_light(bv_color, 'mu36')


Out[58]:
array([ 0.47,  0.67,  1.03,  0.8 ])

Ну да, тут все похоже честно. Смущает конечно разница в центральной яркости с S4G, причем я не смог ничего найти насчет депроецировано или нет. Если депроецировать - становятся похожи:


In [59]:
mu_face_on(mu0d_36, cos_i)


Out[59]:
20.033920528698818

Добавим и депроецированные и нет:


In [60]:
all_photometry.append(('infra 3.6', r_eff_36, mu_eff_36, n_36, mu0d_36, h_disc_36, M_to_L_s4g, 
                       lambda l: s4g_surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_36, h=h_disc_36), M_to_L=M_to_L_s4g)))

all_photometry.append(('infra 3.6 face-on', r_eff_36, mu_eff_36, n_36, mu_face_on(mu0d_36, cos_i), h_disc_36, M_to_L_s4g, 
                       lambda l: s4g_surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu_face_on(mu0d_36, cos_i), h=h_disc_36), M_to_L=M_to_L_s4g)))

Суммарная картинка:


In [61]:
for photom in all_photometry:
    plt.plot(p_, map(photom[-1], p_), '-', label=photom[0])
plt.ylabel('$M_{sun}/{pc}^2$', fontsize=15.)
plt.legend(loc='best')
plt.legend()


Out[61]:
<matplotlib.legend.Legend at 0xd775668>

Неплохо.


In [62]:
show_all_photometry_table(all_photometry, scale)


+------+-------------------+---------+----------+--------+---------+----------+-------+-------------+-----------+
|      | Name              |   r_eff |   mu_eff |      n |   mu0_d |   h_disc |   M/L | M_d/M_sun   |   Sigma_0 |
|------+-------------------+---------+----------+--------+---------+----------+-------+-------------+-----------|
| 0.00 | S4G 3.6           |   10.14 |   nan    |   2.21 |   20.34 |    73.20 |  0.68 | 9.26E+10.   |       286 |
| 1.00 | Heidt J           |  nan    |   nan    | nan    |   17.78 |    49.99 |  0.75 | 1.06E+11.   |       703 |
| 2.00 | Heidt H           |  nan    |   nan    | nan    |   17.11 |    50.28 |  0.69 | 1.36E+11.   |       891 |
| 3.00 | Heidt K           |  nan    |   nan    | nan    |   17.01 |    54.66 |  0.65 | 1.60E+11.   |       889 |
| 4.00 | infra 3.6         |   15.72 |    17.49 |   3.61 |   19.65 |    71.86 |  0.68 | 1.68E+11.   |       539 |
| 5.00 | infra 3.6 face-on |   15.72 |    17.49 |   3.61 |   20.03 |    71.86 |  0.68 | 1.18E+11.   |       379 |
+------+-------------------+---------+----------+--------+---------+----------+-------+-------------+-----------+

Сравнение с Кривой вращения тонкого диска

Можно провести тест-сравнение с кривой вращения тонкого диска при заданной фотометрии, если она слишком массивная - то не брать ее (это ограничение сверху).


In [63]:
fig = plt.figure(figsize=[10,6])

plt.plot(_1, _2, 'd', label='HI Eymeren+2011')
plt.plot(test_points, spl_gas_N(test_points), '-', label='spline N')

plt.plot(r_n[:-20], vel_n[:-20], 'v', label='HI Noord+2005')

for photom in all_photometry:
    plt.plot(test_points, map(lambda l: disc_vel(l, photom[7](0), photom[5], scale), test_points), '--', label=photom[0])


plt.ylim(0, 300)
plt.xlim(0, 300)
plt.legend(loc='best');


Все достаточно хорошо.

Зоны звездообразования

$H_{\alpha}$ , $UV$

есть $H_{\alpha}$ в Hameed 2005 http://iopscience.iop.org/article/10.1086/430211/pdf

ВАЖНО: в этой работе расстояние вообще 12.4 Мпк, соответственно неправильно пересчитываются масштабы

TODO: разобраться с расстояниями-масштабами, проверить в других галактиках


In [64]:
Image('n4725_halpha.png')


Out[64]:

In [65]:
Image('n4725_halpha_dist.png')


Out[65]:

Совмещенная картинка $H_{\alpha}$ + SDSS: (на самом деле совместил не очень качествено - видно например по трем звездам в центре)


In [66]:
Image('n4725_halpha_plus_sdss.png')


Out[66]:

В обратную сторону совмещенная:


In [67]:
Image('n4725_SDSS_labeled_plus_halpha.jpg')


Out[67]:

In [68]:
#SDSS
print 251*300/238. #arcsec
print 251*300/238.*0.130 #kpc, for distance 26.8 Mpc
#Hameed
print 161./9. #kpc
#distance ratio
print 26.8/12.4
print 41./17.9


316.386554622
41.1302521008
17.8888888889
2.16129032258
2.2905027933

Т.е. можно считать, что для исправления надо примерно *2.2 (чтобы привести к такому же масштабу, как SDSS), но тогда не очень точно получается спираль внешняя. Проще всего еще раз перемерить для SDSS картинки: (также здесь отмечены звезды, для которых я мерял выше расстояния)


In [69]:
Image('n4725_SDSS_labeled_sizes.jpg', width=600)


Out[69]:

In [70]:
def plot_SF(ax):
#     как было
#     ax.plot([0., 35.5/2./9./scale], [0., 0.], '-', lw=7., color='red')
#     ax.plot([107./2./9./scale, 177./2./9./scale], [0., 0.], '-', lw=7., color='red')
#     ax.plot([146./9./scale, 169./9./scale], [0., 0.], '-', lw=7., color='b') #внешняя спираль

    ax.plot([0., 300./238 * 161./4.], [0., 0.], '-', lw=7., color='red') #очень примерно, потому что в SDSS не видно, но оно там есть
    ax.plot([300./238 * 161./4., 300./238 *268./2.], [0., 0.], '--', lw=6., color='red', alpha=0.5) #в спитцере видно слабое
    ax.plot([300./238 * 161./2., 300./238 *268./2.], [0., 0.], '-', lw=7., color='red')
    ax.plot([300./238 *220., 300./238 *240], [0., 0.], '-', lw=7., color='b') #внешняя спираль, ширина условна
    
plot_SF(plt.gca())
plt.xlim(0, 350)
plt.ylim(0, 200)


Out[70]:
(0, 200)

Видно, что теперь внешняя спираль находится на втором горбе данных, как и должно быть.

Есть еще ИК изображение от SPITZER http://www.spitzer.caltech.edu/images/2355-sig05-011-NGC-4725

Red represents warm dust clouds illuminated by newborn stars, while blue indicates older, cooler stellar populations.


In [71]:
Image('n4725_SPITZER.jpg', width=500)


Out[71]:

Неустойчивость

Одножидкостная

Устойчиво, когда > 1: $$Q_g = \frac{\Sigma_g^{cr}}{\Sigma_g}=\frac{\kappa c_g}{\pi G \Sigma_g}$$ $$Q_s = \frac{\Sigma_s^{cr}}{\Sigma_s}=\frac{\sigma_R}{\sigma_R^{min}}=\frac{\kappa \sigma_R}{3.36 G \Sigma_s}$$


In [72]:
sound_vel = 6  #скорость звука в газе, км/с
data_lim = max(r_sig_ma) #где заканчиваются данные

In [73]:
fig = plt.figure(figsize=[12, 6])
gd_data = zip(r_g_dens, gas_dens)

plt.plot(r_g_dens, [1./Qg(epicycl=l[0], sound_vel=sound_vel, gas_density=l[1]) for l in 
                    zip([epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in r_g_dens], gas_dens)], 's-', label='$Q_{gas}$')
plt.plot(r_g_dens, [1./Qg(epicycl=l[0], sound_vel=4., gas_density=l[1]) for l in 
                    zip([epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in r_g_dens], gas_dens)], 's-', label='$Q_{gas}$ & c=4')

plt.plot(r_g_dens, [1./Qs(epicycl=l[0], sigma=l[1], star_density=l[2]) for l in 
                    zip([epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in r_g_dens],
                        map(sig_R_maj_max, r_g_dens), 
                        [surf_density(l_, M_to_L_K, 'K') for l_ in [mu_disc(ll, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K) for ll in r_g_dens]])], 's-', label='$Q_{star}^{max}$')

plt.plot(r_g_dens, [1./Qs(epicycl=l[0], sigma=l[1], star_density=l[2]) for l in 
                    zip([epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in r_g_dens],
                        map(sig_R_maj_min, r_g_dens), 
                        [surf_density(l_, M_to_L_K, 'K') for l_ in [mu_disc(ll, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K) for ll in r_g_dens]])], 's-', label='$Q_{star}^{min}$')

plt.axhline(y=1, ls='--')
plt.legend()
plot_SF(plt.gca())
plt.ylabel('$Q^{-1}$', fontsize=15);


Видно, что в центре с кучей газа неустойчивость, но эффект быстро спадает.

НЕ ИСПРАВЛЕНО ЗА 1.6! И не надо.

Для внешней спирали что-то видно, давайте сохраним картинку:


In [74]:
fig = plt.figure(figsize=[12, 6])
gd_data = zip(r_g_dens, gas_dens)

plt.plot(r_g_dens, [1./Qg(epicycl=l[0], sound_vel=sound_vel, gas_density=l[1]) for l in 
                    zip([epicyclicFreq_real(spl_gas, x, scale) for x in r_g_dens], gas_dens)], 's-', label='$Q_{g}^{-1}$')

plt.axhline(y=1, ls='--')
plt.legend()
plot_SF(plt.gca())
plt.ylabel('$Q^{-1}$', fontsize=15)
plt.title(name)
plot_Q_levels(plt.gca(), [1., 1.5, 2., 3.])
plt.savefig('..\\..\pics\\instab_spirals\\'+name+'_spiral'+'.png', format='png', bbox_inches='tight');


Двухжидкостная

Кинетическое приближение: $$\frac{1}{Q_{\mathrm{eff}}}=\frac{2}{Q_{\mathrm{s}}}\frac{1}{\bar{k}}\left[1-e^{-\bar{k}^{2}}I_{0}(\bar{k}^{2})\right]+\frac{2}{Q_{\mathrm{g}}}s\frac{\bar{k}}{1+\bar{k}^{2}s^{2}}>1\,$$

Гидродинамическое приближение: $$\frac{2\,\pi\, G\, k\,\Sigma_{\mathrm{s}}}{\kappa+k^{2}\sigma_{\mathrm{s}}}+\frac{2\,\pi\, G\, k\,\Sigma_{\mathrm{g}}}{\kappa+k^{2}c_{\mathrm{g}}}>1$$ или $$\frac{1}{Q_{\mathrm{eff}}}=\frac{2}{Q_{\mathrm{s}}}\frac{\bar{k}}{1+\bar{k}^{2}}+\frac{2}{Q_{\mathrm{g}}}s\frac{\bar{k}}{1+\bar{k}^{2}s^{2}}>1$$ для безразмерного волнового числа ${\displaystyle \bar{k}\equiv\frac{k\,\sigma_{\mathrm{s}}}{\kappa}},\, s=c/\sigma$


In [75]:
total_gas_data = zip(r_g_dens, map(lambda l: l, gas_dens))[:10]
disk_scales = [(l[5], l[0].split(' ')[1]) for l in all_photometry]

fig = plt.figure(figsize=[10, 6])
ax = plt.gca()

plot_2f_vs_1f(ax=ax, total_gas_data=total_gas_data, epicycl=epicyclicFreq_real, 
              gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=lambda l: surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K), M_to_L_K, 'K'), 
              star_density_min=lambda l: surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_K, h=h_disc_K), M_to_L_K, 'K'), 
              data_lim=data_lim, color='g', alpha=0.3, disk_scales=disk_scales, label='K maj max/min')

plt.ylim(0., 2.5)
plt.axhline(y=1., ls='-', color='grey')
plot_SF(ax)
plt.grid();


End


In [76]:
from matplotlib.animation import FuncAnimation

fig = plt.gcf()
plt.figure(figsize=(10,6))

ax = plt.gca()

def animate(i):
    ax.cla()
    plot_2f_vs_1f(ax=ax, total_gas_data=total_gas_data, epicycl=epicyclicFreq_real, gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=all_photometry[i][-1], 
              star_density_min=all_photometry[i][-1],
              data_lim=data_lim, color=np.random.rand(3), alpha=0.3, disk_scales=[(all_photometry[i][5], '')])
    ax.axhline(y=1., ls='-', color='grey')
    ax.set_title(all_photometry[i][0])
    ax.set_ylim(0., 2.5)
    return ax
anim = FuncAnimation(plt.gcf(), animate, frames=len(all_photometry), interval=1000)


C:\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\axes\_axes.py:519: UserWarning: No labelled objects found. Use label='...' kwarg on individual plots.
  warnings.warn("No labelled objects found. "
<matplotlib.figure.Figure at 0x10fb2518>

In [77]:
anim.save('..\\..\pics\\'+name+'.gif', writer='imagemagick', fps=1)

In [78]:
from IPython.display import HTML
HTML(anim.to_html5_video())


Out[78]:

Самый максимальный диск

Существует ограничение на максимальный диск в ~0.85 (изотермическое гало) и на субмаксимальный в 0.55-0.6 (NFW гало). Попробуем дотянуть фотметрию до максимальных дисков и посмотрим, как изменятся M/L (скорость зависит как корень из M/L):


In [79]:
fig = plt.figure(figsize=[14,6])

plt.plot(test_points, spl_gas(test_points), '-', label='spline')
plt.plot(test_points, 0.85*spl_gas(test_points), '--', label='max disc')
# plt.plot(test_points, 0.6*spl_gas(test_points), '--', label='submax disc')
# plt.errorbar(r_wsrt, vel_wsrt, yerr=e_vel_wsrt, fmt='.', marker='.', mew=0, label = 'WSRT')
# plt.plot(r, vel, '.', label = 'Noord thesis')

max_coeffs = {}

for photom in all_photometry:
    disc_max = 2.2*photom[5]
    max_coeff = 0.85*spl_gas(disc_max)/disc_vel(disc_max, photom[7](0), photom[5], scale)
    submax_coeff = 0.6*spl_gas(disc_max)/disc_vel(disc_max, photom[7](0), photom[5], scale)
    
    plt.plot(test_points, map(lambda l: disc_vel(l, max_coeff**2 * photom[7](0), photom[5], scale), test_points), next(linecycler), label=photom[0] + '_MAX')
    
    print '{:15s}: M/L was {:2.2f} and for max it equal {:2.2f}, for submax equal {:2.2f}'.format(photom[0], photom[6], photom[6]*max_coeff**2, photom[6]*submax_coeff**2)
    max_coeffs[photom[0]] = [max_coeff**2, submax_coeff**2]


plt.ylim(0, 300)
plt.xlim(0, 300)
plt.legend(bbox_to_anchor=(1.15, 1.0));


S4G 3.6        : M/L was 0.68 and for max it equal 1.61, for submax equal 0.80
Heidt J        : M/L was 0.75 and for max it equal 0.94, for submax equal 0.47
Heidt H        : M/L was 0.69 and for max it equal 0.68, for submax equal 0.34
Heidt K        : M/L was 0.65 and for max it equal 0.61, for submax equal 0.31
infra 3.6      : M/L was 0.68 and for max it equal 0.87, for submax equal 0.43
infra 3.6 face-on: M/L was 0.68 and for max it equal 1.24, for submax equal 0.62

Значения я бы даже сказал маленькие.


In [80]:
from matplotlib.animation import FuncAnimation

fig = plt.gcf()
plt.figure(figsize=(10,6))

ax = plt.gca()

def animate(i):
    ax.cla()
    
    plot_2f_vs_1f(ax=ax, total_gas_data=total_gas_data, epicycl=epicyclicFreq_real, gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=lambda l: max_coeffs[all_photometry[i][0]][0]*all_photometry[i][-1](l), 
              star_density_min=lambda l: max_coeffs[all_photometry[i][0]][0]*all_photometry[i][-1](l),
              data_lim=data_lim, color=np.random.rand(3), alpha=0.3, disk_scales=[(all_photometry[i][5], '')])
    
    plot_2f_vs_1f(ax=ax, total_gas_data=total_gas_data, epicycl=epicyclicFreq_real, gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=lambda l: max_coeffs[all_photometry[i][0]][1]*all_photometry[i][-1](l), 
              star_density_min=lambda l: max_coeffs[all_photometry[i][0]][1]*all_photometry[i][-1](l),
              data_lim=data_lim, color=np.random.rand(3), alpha=0.3, disk_scales=[(all_photometry[i][5], '')])
    
    ax.axhline(y=1., ls='-', color='grey')
    ax.set_title(all_photometry[i][0])
    ax.set_ylim(0., 2.5)
    ax.set_xlim(0., 160.)
    plot_SF(ax)
    plot_Q_levels(ax, [1., 1.5, 2., 3.])
    return ax
anim = FuncAnimation(plt.gcf(), animate, frames=len(all_photometry), interval=1000)


<matplotlib.figure.Figure at 0xd744898>

In [81]:
anim.save('..\\..\pics\\'+name+'_MAXDISCS.gif', writer='imagemagick', fps=1)

In [82]:
from IPython.display import HTML
HTML(anim.to_html5_video())


Out[82]:

Есть очень неплохие модели.

Картинка


In [83]:
summary_imgs_path = '..\\..\pics\\notebook_summary\\'

def save_model_plot(path):
    fig, axes = plt.subplots(1, 5, figsize=[40,7])
    fig.tight_layout()
    
    axes[0].imshow(ImagePIL.open('n4725_SDSS_labeled.jpg'), aspect='auto')
    axes[0].set_title(name)
    
    try:
        axes[1].errorbar(r_sig_ma, sig_ma, yerr=e_sig_ma, fmt='.', marker='.', mew=0, color='red', label='$\sigma_{los}^{maj}$')
        axes[1].plot(points, map(sig_R_maj_min, points))
        axes[1].plot(points, map(sig_R_maj_max, points))
        axes[1].plot(points, map(sig_R_maj_maxmaxtrue, points))
    except Exception:
        pass
    
    try:
        axes[1].errorbar(r_sig_mi, sig_mi, yerr=e_sig_mi, fmt='.', marker='.', mew=0, color='red', label='$\sigma_{los}^{min}$')
        axes[1].plot(points, map(sig_R_minor_min, points), '--')
        axes[1].plot(points, map(sig_R_minor_max, points), '--')
    except Exception:
        pass

    axes[1].set_ylim(0,250)
    axes[1].set_xlim(0, 105)  
    axes[1].grid()
    axes[1].legend()
    axes[1].set_title('Dispersions')
    
    for photom in all_photometry:
        axes[2].plot(r_g_dens, map(photom[-1], r_g_dens), '-', label='{} [M/L={:2.2f}]'.format(photom[0], photom[-2]))
    axes[2].set_xlim(0, 150)
    axes[2].set_ylim(0, 300)
    axes[2].set_title('Photometry')
    axes[2].grid()
    axes[2].legend()
    
    axes[3].plot(r_HI_dens, HI_dens, '--', label='HI')
    axes[3].plot(zip(*total_gas_data)[0], zip(*total_gas_data)[1], '*-')
    axes[3].plot(r_mol_dens, mol_dens, '--', label='mol')
    axes[3].set_title('Gas')
    axes[3].grid()
    axes[3].set_xlim(0, 200)
    axes[3].legend()
       
    #change this
    plot_2f_vs_1f(ax=axes[4], total_gas_data=zip(r_g_dens, map(lambda l: l, gas_dens))[:15], epicycl=epicyclicFreq_real, 
              gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=lambda l: surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_H, h=h_disc_H), M_to_L=0.68, band='H'), 
              star_density_min=lambda l: surf_density(mu=mu_disc(l, mu0=mu0d_H, h=h_disc_H), M_to_L=0.68, band='H'), 
              data_lim=data_lim, color='y', alpha=0.3, disk_scales=disk_scales, label='H Heidt maxdisc')
    
    plot_2f_vs_1f(ax=axes[4], total_gas_data=zip(r_g_dens, map(lambda l: l, gas_dens))[:15], epicycl=epicyclicFreq_real, 
              gas_approx=spl_gas, sound_vel=sound_vel, scale=scale, 
              sigma_max=sig_R_maj_max, 
              sigma_min=sig_R_maj_min, 
              star_density_max=lambda l: s4g_surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_s4g, h=h_disc_s4g), 1.61), 
              star_density_min=lambda l: s4g_surf_density(mu_disc(l, mu0=mu0d_s4g, h=h_disc_s4g), 1.61), 
              data_lim=data_lim, color='g', alpha=0.2, disk_scales=disk_scales, label='S4G maxdisc')

    axes[4].set_ylim(0., 2.5)
    axes[4].set_xlim(0., 130.)
    axes[4].axhline(y=1., ls='-', color='grey')
    plot_SF(axes[4])
    axes[4].grid()
    axes[4].set_title('Instability')
    axes[4].text(10., 2.2, '+S', fontsize=25., color='b')
       
#     plt.savefig(path+name+'.png', format='png', bbox_inches='tight');
    
save_model_plot(summary_imgs_path)