In [2]:
import json
import networkx as nx
from networkx.readwrite import json_graph
Minimimum spanning viz preperations
In [10]:
g = nx.read_gexf("js_viz/graphs/cutlines_gc_from_gephi.gephi")
In [11]:
tree = nx.minimum_spanning_tree(g)
In [12]:
data = json_graph.node_link_data(tree)
In [13]:
with open("js_viz/graphs/spanning_tree.json", "w") as f:
json.dump(data, f)
In [14]:
data["nodes"][0]
Out[14]:
{'Modularity Class': 0,
'avg_date': '1608',
'doc_type': "{u'Impresion': 6}",
'fecha': "{'1616-09-12': 1, '1615-03-23': 1, '1598-11-27': 1, '1599-04-26': 1, '1617-11-16': 1, '1604-07-28': 1}",
'genero': "{'Teatro': 1, 'Ficcion': 3, 'Poesia': 2}",
'id': '97',
'label': 'Luis Sanchez',
'lugar': "{u'Madrid': 5, u'Valladolid': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'second_genre': 'Poesia',
'second_place': 'Valladolid',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 214, 'g': 73, 'r': 26},
'position': {'x': 300.5366, 'y': 213.90012, 'z': 0.0},
'size': 4.418605}}
In [26]:
g = nx.read_gexf("js_viz/graphs/mod0_from_gephi.gexf")
tree = nx.minimum_spanning_tree(g)
data = json_graph.node_link_data(tree)
with open("js_viz/graphs/mod0spanning_tree.json", "w") as f:
json.dump(data, f)
Remove Lope
In [22]:
g.remove_node('440')
In [23]:
g.node['440']
---------------------------------------------------------------------------
KeyError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-23-8a5affd390d7> in <module>()
----> 1 g.node['440']
KeyError: '440'
In [27]:
tree = nx.minimum_spanning_tree(g)
data = json_graph.node_link_data(tree)
with open("js_viz/graphs/mod0.json", "w") as f:
json.dump(data, f)
In [32]:
def group_by_top_place(g):
places = {}
current = 1
for n, attrs in g.nodes(data=True):
tp = attrs["top_place"]
if tp not in places:
places[tp] = int(current)
group = int(current)
current += 1
else:
group = places[tp]
g.node[n]["group"] = group
return g
In [33]:
g = nx.read_gexf("js_viz/graphs/no_auth_from_gephi.gexf")
g = group_by_top_place(g)
tree = nx.minimum_spanning_tree(g)
data = json_graph.node_link_data(tree)
with open("js_viz/graphs/no_auth_patron_tree.json", "w") as f:
json.dump(data, f)
In [34]:
g.nodes(data=True)
Out[34]:
[('199',
{'Modularity Class': 9,
'avg_date': '1616',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 1}",
'fecha': "{'1616-06-06': 1}",
'genero': "{'Poesia': 1}",
'group': 1,
'inst': "{u'Diocesis de Lerida': 1}",
'label': 'Doctor Galipienzo',
'lugar': "{u'Lerida': 1}",
'notas': "{'Catedratico de prima de Lerida': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Poesia',
'top_place': 'Lerida',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -475.72827, 'y': -492.76547, 'z': 0.0},
'size': 1.4736842}}),
('97',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1608',
'doc_type': "{u'Impresion': 6}",
'fecha': "{'1616-09-12': 1, '1615-03-23': 1, '1598-11-27': 1, '1599-04-26': 1, '1617-11-16': 1, '1604-07-28': 1}",
'genero': "{'Teatro': 1, 'Ficcion': 3, 'Poesia': 2}",
'group': 2,
'label': 'Luis Sanchez',
'lugar': "{u'Madrid': 5, u'Valladolid': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'second_genre': 'Poesia',
'second_place': 'Valladolid',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -451.0089, 'y': 413.07275, 'z': 0.0},
'size': 4.315789}}),
('187',
{'Modularity Class': 14,
'avg_date': '1607',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1607-11-07': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 1}",
'group': 3,
'inst': "{u'Consejo de Flandes': 1}",
'label': 'Grimaldy',
'lugar': "{u'Bruselas': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Bruselas',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 141.0622, 'y': -99.741844, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('9',
{'Modularity Class': 11,
'avg_date': '1617',
'doc_type': "{u'Impresion': 1}",
'fecha': "{'1617-01-27': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 1}",
'group': 4,
'label': 'Sebastian Matevat',
'lugar': "{u'Barcelona': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Barcelona',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -434.46674, 'y': 165.24677, 'z': 0.0},
'size': 2.1842105}}),
('259',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1608',
'doc_type': "{u'Tasa': 10, u'Privilegio/Licencia': 5}",
'fecha': "{'1613-02-28': 1, '1610-11-10': 1, '1609-02-10': 1, '1612-12-16': 1, '1604-02-20': 1, '1609-08-11': 1, '1599-03-17': 1, '1612-02-09': 1, '1611-04-14': 1, '1605-07-14': 1, '1609-10-04': 1, '1612-10-11': 1, '1604-07-28': 1, '1611-06-22': 1, '1609-11-18': 1}",
'genero': "{'Teatro': 6, 'Ficcion': 1, 'Poesia': 5}",
'group': 2,
'inst': "{u'Consejo de Castilla': 1}",
'label': 'Miguel de Ondarza Zabala',
'lugar': "{'': 1, u'Madrid': 11, u'Valladolid': 3}",
'notas': "{'Escribano de Camara': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'second_genre': 'Poesia',
'second_place': 'Valladolid',
'top_genre': 'Teatro',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -366.30994, 'y': 345.9394, 'z': 0.0},
'size': 5.0263157}}),
('272',
{'Modularity Class': 1,
'avg_date': '1604',
'doc_type': "{u'Impresion': 1}",
'fecha': "{'1604': 1}",
'genero': "{'Poesia': 1}",
'group': 5,
'label': 'Melchior Ocharte',
'lugar': "{u'Mexico': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'top_genre': 'Poesia',
'top_place': 'Mexico',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -484.74036, 'y': 163.8457, 'z': 0.0},
'size': 1.0}}),
('49',
{'Modularity Class': 7,
'avg_date': '1610',
'doc_type': "{u'Fe de erratas': 2}",
'fecha': "{'1611-06-09': 1, '1609-04-20': 1}",
'genero': "{'Teatro': 2}",
'group': 6,
'label': 'Augustin de Vergara',
'lugar': "{u'Valladolid': 2}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Teatro',
'top_place': 'Valladolid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -147.78818, 'y': 54.564884, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('394',
{'Modularity Class': 8,
'avg_date': '1616',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1616-02-04': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 1}",
'group': 3,
'label': 'DeVitte',
'lugar': "{u'Bruselas': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Bruselas',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 89.33447, 'y': 211.29266, 'z': 0.0},
'size': 1.4736842}}),
('238',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1609',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 1}",
'fecha': "{'1609-07-30': 1}",
'genero': "{'Teatro': 5}",
'group': 2,
'label': 'Alonso Gomez de encinas, Fray',
'lugar': "{u'Madrid': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Teatro',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 298.95496, 'y': 351.17303, 'z': 0.0},
'size': 3.368421}}),
('102',
{'Modularity Class': 2,
'avg_date': '1614',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 3}",
'fecha': "{'1613-05-05': 1, '1614-01-06': 1, '1617-06-10': 1}",
'genero': "{'Historia': 2, 'Ficcion': 1}",
'group': 2,
'inst': "{u'Consejo de Castilla': 1}",
'label': 'Pedro de Valencia',
'lugar': "{u'Madrid': 3}",
'notas': "{'Coronista del Rey': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'second_genre': 'Ficcion',
'top_genre': 'Historia',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -358.83026, 'y': 414.05914, 'z': 0.0},
'size': 1.9473684}}),
('106',
{'Modularity Class': 5,
'avg_date': '1617',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1617-08-15': 1}",
'genero': "{'Historia': 1}",
'group': 7,
'inst': "{u'Archidiocesis de Zaragoza': 1}",
'label': 'Pedro de Molina, Vicario General de Zaragoza',
'lugar': "{u'Zaragoza': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Historia',
'top_place': 'Zaragoza',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 232.89148, 'y': -248.00183, 'z': 0.0},
'size': 2.1842105}}),
('66',
{'Modularity Class': 3,
'avg_date': '1598',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 1}",
'fecha': "{'1598-01-13': 1}",
'genero': "{'': 1, 'Ficcion': 2}",
'group': 2,
'inst': "{u'Consejo de Castilla': 1}",
'label': 'Diego Davilo, Fray',
'lugar': "{u'Madrid': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -34.153656, 'y': 297.23657, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('131',
{'Modularity Class': 4,
'avg_date': '1615',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 2}",
'fecha': "{'1617-09-17': 1, '1614-01-11': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 4}",
'group': 8,
'inst': "{u'Consejo de Navarra': 1}",
'label': 'Pedro de Zunzarren',
'lugar': "{u'Pamplona': 2}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Pamplona',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 311.39996, 'y': -113.2835, 'z': 0.0},
'size': 1.9473684}}),
('205',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1613',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 2}",
'fecha': "{'1613-08-09': 1, '1613-08-23': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 2, 'Poesia': 1}",
'group': 2,
'inst': "{u'San Lorenzo el Real de El Escorial': 1}",
'label': 'Francisco Gassoi',
'lugar': "{u'Madrid': 2}",
'notas': "{'¿Gasol?': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'second_genre': 'Poesia',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -320.7514, 'y': 444.69006, 'z': 0.0},
'size': 2.4210525}}),
('276',
{'Modularity Class': 11,
'avg_date': '1603',
'doc_type': "{u'Impresion': 1}",
'fecha': "{'1603-01-01': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 1}",
'group': 9,
'label': 'Roberto',
'lugar': "{u'Tarragona': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Tarragona',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -235.99982, 'y': -300.63983, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('263',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1615',
'doc_type': "{u'Impresion': 6}",
'fecha': "{'1614-11-17': 1, '1614-09-24': 1, '1615-10-19': 1, '1616-01-01': 1, '1614-05-17': 1, '1618-03-06': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 2, 'Poesia': 4}",
'group': 2,
'label': 'Viuda de Alonso Martin',
'lugar': "{u'Madrid': 6}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'second_genre': 'Ficcion',
'top_genre': 'Poesia',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -457.33383, 'y': 203.0758, 'z': 0.0},
'size': 2.8947368}}),
('98',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1617',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 1}",
'fecha': "{'1617-08-10': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 2}",
'group': 2,
'inst': "{u'Orden de San Agustin': 2, u'Consejo de Inquisicion': 1}",
'label': 'Juan de Camargo',
'lugar': "{u'Madrid': 1}",
'notas': "{'Rector del colegio de donna Maria de Aragon, de la orden de San Agustin y calificador de la general inquisicion': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 156.41138, 'y': -165.14417, 'z': 0.0},
'size': 2.1842105}}),
('147',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1603',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 4, u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1604-08-04': 1, '1603-05-15': 1, '1603-11-25': 1, '1604-08-02': 1, '1603-12-11': 1}",
'genero': "{'': 1, 'Ficcion': 8}",
'group': 6,
'label': 'Tomas Gracian Dantisco',
'lugar': "{u'Valladolid': 5}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Valladolid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 304.7046, 'y': 297.6372, 'z': 0.0},
'size': 5.5}}),
('109',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1612',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 2}",
'fecha': "{'1612-05-10': 1, '1612-07-09': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 4, 'Poesia': 1}",
'group': 2,
'inst': "{u'Convento de la Santisima Trinidad': 1}",
'label': 'Juan Bautista',
'lugar': "{u'Madrid': 2}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'second_genre': 'Poesia',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -59.685577, 'y': 39.083073, 'z': 0.0},
'size': 2.4210525}}),
('224',
{'Modularity Class': 11,
'avg_date': '1617',
'doc_type': "{u'Impresion': 1}",
'fecha': "{'1617-01-01': 1}",
'genero': "{'Ficcion': 1}",
'group': 4,
'label': 'Raphael Vives',
'lugar': "{u'Barcelona': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'printer/editor',
'top_genre': 'Ficcion',
'top_place': 'Barcelona',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': -24.16449, 'y': 408.12402, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('341',
{'Modularity Class': 15,
'avg_date': '1608',
'doc_type': "{u'Aprobacion': 1, u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1604-11-10': 1, '1613-08-23': 1}",
'genero': "{'Teatro': 1, 'Poesia': 1}",
'group': 10,
'label': 'Roig',
'lugar': "{u'Valencia': 1, u'Madrid': 1}",
'notas': "{'Vicecanciller encargado general de tesorero': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'second_genre': 'Poesia',
'second_place': 'Madrid',
'top_genre': 'Teatro',
'top_place': 'Valencia',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 404.7124, 'y': 470.4724, 'z': 0.0},
'size': 1.7105262}}),
('395',
{'Modularity Class': 12,
'avg_date': '1609',
'doc_type': "{u'Privilegio/Licencia': 1}",
'fecha': "{'1609-03-15': 1}",
'genero': "{'Poesia': 1}",
'group': 2,
'label': 'Alonso Ordonez de San Pedro',
'lugar': "{u'Madrid': 1}",
'notas': "{'Mayordomo del santisimo sacramento de la parroquial de Toledo': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Poesia',
'top_place': 'Madrid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
'position': {'x': 182.84973, 'y': -493.41098, 'z': 0.0},
'size': 1.4736842}}),
('86',
{'Modularity Class': 7,
'avg_date': '1604',
'doc_type': "{u'Fe de erratas': 1}",
'fecha': "{'1604-07-07': 1}",
'genero': "{'Teatro': 2}",
'group': 6,
'label': 'Alonso Vaca de Santiago',
'lugar': "{u'Valladolid': 1}",
'real': "{'True': 1}",
'role': 'signatory',
'top_genre': 'Teatro',
'top_place': 'Valladolid',
'type': 'Persona',
'viz': {'color': {'a': 1.0, 'b': 153, 'g': 153, 'r': 153},
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'size': 2.1842105}}),
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'label': 'Francisco Paulus Alreus',
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'label': 'Juan de Bonilla',
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