Intersemestre Neuroimagerie IMT Atlantique - 2017 - Résumé des projets proposés

Impact du vieillissement sur la matière grise, en utilisant l’IRM structurelle et l’apprentissage machine. (Farrugia)

Dataset : OASIS

http://www.oasis-brains.org/

Ce dataset de grande taille (plus de 400 sujets) permet d'étudier les variations de la structure de la matière grise par la technique dite de "Voxel Based Morphometry". Le dataset dispose de sujets de tout ages, ainsi que des scores sur la démence.

Description complète ici

Plusieurs projets sont possibles à partir de ce dataset : impact du vieillissement, impact de la démence, de la maladie d'Alzheimer.

Recherche de bio-marqueurs du spectre des troubles autistiques à partir de la connectivité mesurée par l’IRM fonctionnelle. (Farrugia)

Dataset : Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE)

http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fnhum.2013.00599/full

On trouve dans ce dataset des données de connectivité cérébrale en utilisant l'IRM fonctionnelle au repos, ainsi qu'une description des patients utilisant de nombreux critères couvrant le spectre des troubles autistiques.

Lien entre le Connectome et la Schizophrénie en utilisant l'IRM fonctionnelle

Dataset : COBRE

Ce projet propose de faire le lien entre des profils cliniques de Schizophrénie et la connectivité fonctionnelle mesurée au repos. Nous appliquerons les méthodes de l'apprentissage machine afin de détecter des patterns caractéristiques typiques de la pathologie.

Décodage de l’activité cérébrale évoquée lors d’une expérience l’IRM fonctionnelle (stimulations visuelles). (Farrugia)

Dataset : Haxby

Haxby, J., Gobbini, M., Furey, M., Ishai, A., Schouten, J., and Pietrini, P. (2001). Distributed and overlapping representations of faces and objects in ventral temporal cortex. Science 293, 2425-2430.

L'objectif de ce projet est d'appliquer des méthodes de l'apprentissage machine afin de classifier l'activité neurale en fonction des catégories d'objets.

Reconstruction de l’image vue par un sujet à partir des signaux d’IRM fonctionnelle. (Farrugia)

Dataset : Miyawaki (publication ici )

Reconstruction de la connectivité cérébrale de la matière blanche (tractographie) par IRM de diffusion. (Rousseau)

Décomposition du cortex en sous-régions en utilisant l’IRM de diffusion et l’IRM fonctionnelle. (Farrugia + Rousseau)


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