In [2]:
from IPython.display import display
import pandas as pd
In [3]:
open_ref_old = '../analysis_data/old_open_ref.txt.gz'
In [4]:
pd_open = pd.read_csv(open_ref_old, sep='\t', header=1, index_col=-1)
In [5]:
del pd_open['MP.NegC.1']
del pd_open['MP.NegC.2']
In [6]:
pd_open.sum()
Out[6]:
#OTU ID 4479944973124430731672899118510011407256211443...
MP.31 29312
MP.18 19968
MP.21 15605
MP.23 19229
MP.42 23910
MP.39 27952
MP.28 22647
MP.45 27336
MP.36 19679
MP.13 20877
MP.53 36460
MP.40 34664
MP.56 26165
MP.16 15544
MP.43 22539
MP.50 33148
MP.6 24742
MP.58 27170
MP.26 21719
MP.9 25242
MP.37 32634
MP.35 24067
MP.27 23574
MP.15 20147
MP.46 28176
MP.34 30045
MP.55 33809
MP.3 25013
MP.32 26940
...
MP.7 23529
MP.4 21891
MP.17 16369
MP.51 26541
MP.2 24982
MP.10 18877
MP.11 17752
MP.54 31801
MP.12 19640
MP.62 30377
MP.5 18830
MP.1 21332
MP.8 21891
MP.22 18401
MP.19 38304
MP.41 26206
MP.14 19046
MP.60 25012
MP.49 26582
MP.52 30655
MP.24 8939
MP.47 24954
MP.20 23825
MP.61 30926
MP.48 29727
MP.44 32
MP.25 26
MP.38 23
MP.33 45
MP.57 43
dtype: object
In [5]:
open_sum = pd_open.sum(1).sort_values(ascending=False)
open_sum
Out[5]:
taxonomy
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 92711.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 35731.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Stigonematales; f__Rivulariaceae; g__Calothrix; s__ 34326.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Bacillales; f__[Exiguobacteraceae]; g__Exiguobacterium; s__ 28875.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Oscillatoriales; f__Phormidiaceae; g__Phormidium; s__ 26202.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 23640.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__; g__; s__ 23023.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Nostocales; f__Nostocaceae; g__; s__ 22820.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Sphingomonadaceae; g__Zymomonas; s__ 18995.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__; g__; s__ 15271.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Nostocales; f__Nostocaceae; g__; s__ 13085.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Erythrobacteraceae; g__; s__ 11537.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Anaerospora; s__ 11509.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__; g__; s__ 10688.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Nostocales; f__Nostocaceae; g__; s__ 10218.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Stigonematales; f__Rivulariaceae; g__Calothrix; s__ 8616.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__; g__; s__ 8608.0
k__Bacteria; p__Verrucomicrobia; c__Verrucomicrobiae; o__Verrucomicrobiales; f__Verrucomicrobiaceae; g__Luteolibacter; s__ 8571.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__; g__; s__ 8531.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Nostocales; f__Nostocaceae; g__; s__ 8526.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Aeromonadales; f__Aeromonadaceae; g__; s__ 8214.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Chloroplast; o__Stramenopiles; f__; g__; s__ 7716.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 7700.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 7637.0
k__Bacteria; p__Planctomycetes; c__Planctomycetia; o__Pirellulales; f__Pirellulaceae; g__; s__ 7498.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Stigonematales; f__Rivulariaceae; g__Calothrix; s__ 7355.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Sphingomonadaceae; g__Sphingopyxis; s__alaskensis 7315.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes; c__[Saprospirae]; o__[Saprospirales]; f__Saprospiraceae; g__; s__ 7209.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Xanthomonadales; f__Xanthomonadaceae; g__; s__ 7203.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Stigonematales; f__Rivulariaceae; g__Calothrix; s__ 6933.0
...
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__Brucellaceae; g__Ochrobactrum; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Enterobacteriales; f__Enterobacteriaceae 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Rhodocyclales; f__Rhodocyclaceae; g__Azospira; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__Corynebacteriaceae; g__Corynebacterium; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__Brucellaceae; g__Ochrobactrum; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Lactobacillaceae; g__Lactobacillus; s__reuteri 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Moraxellaceae; g__Enhydrobacter; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Lactobacillaceae; g__Lactobacillus 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Oxalobacteraceae; g__; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Burkholderiaceae; g__Burkholderia; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Lactobacillaceae; g__Lactobacillus; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Enterococcaceae; g__Enterococcus; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Lactobacillaceae; g__Lactobacillus; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Bacillales; f__Bacillaceae; g__Bacillus; s__muralis 0.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Bifidobacteriales; f__Bifidobacteriaceae; g__Bifidobacterium 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Bifidobacteriales; f__Bifidobacteriaceae; g__Bifidobacterium; s__adolescentis 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Burkholderiaceae; g__Burkholderia; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Oxalobacteraceae; g__; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes; c__Flavobacteriia; o__Flavobacteriales; f__[Weeksellaceae]; g__Cloacibacterium; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Lactobacillales; f__Lactobacillaceae; g__Lactobacillus; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Rhodocyclales; f__Rhodocyclaceae; g__Azospira; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Pseudomonadales; f__Pseudomonadaceae; g__Pseudomonas; s__ 0.0
dtype: float64
In [6]:
open_group = open_sum.groupby(open_sum.index).sum().sort_values(ascending=False)
open_group
Out[6]:
taxonomy
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Rhodobacter; s__ 218343.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__; g__; s__ 69654.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Stigonematales; f__Rivulariaceae; g__Calothrix; s__ 65061.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__; g__; s__ 64180.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Nostocophycideae; o__Nostocales; f__Nostocaceae; g__; s__ 62551.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Bacillales; f__[Exiguobacteraceae]; g__Exiguobacterium; s__ 33561.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes; c__[Saprospirae]; o__[Saprospirales]; f__Saprospiraceae; g__; s__ 32600.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Sphingomonadaceae; g__Zymomonas; s__ 29645.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes; c__Cytophagia; o__Cytophagales; f__Cytophagaceae; g__; s__ 29507.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes; c__[Saprospirae]; o__[Saprospirales]; f__Chitinophagaceae; g__; s__ 29037.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Oscillatoriales; f__Phormidiaceae; g__Phormidium; s__ 28819.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Chloroplast; o__Stramenopiles; f__; g__; s__ 27731.0
k__Bacteria; p__Planctomycetes; c__Planctomycetia; o__Pirellulales; f__Pirellulaceae; g__; s__ 26720.0
k__Bacteria; p__Verrucomicrobia; c__Verrucomicrobiae; o__Verrucomicrobiales; f__Verrucomicrobiaceae; g__Luteolibacter; s__ 25952.0
Unassigned 24218.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Comamonadaceae; g__; s__ 23840.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Sphingomonadaceae; g__; s__ 18844.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Oxalobacteraceae; g__; s__ 17188.0
k__Bacteria; p__Planctomycetes; c__Planctomycetia; o__Gemmatales; f__Gemmataceae; g__Gemmata; s__ 16091.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Xanthomonadales; f__Xanthomonadaceae; g__; s__ 16071.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Sphingomonadales; f__Erythrobacteraceae; g__; s__ 15187.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodobacterales; f__Rhodobacteraceae; g__Anaerospora; s__ 13689.0
k__Bacteria; p__Verrucomicrobia; c__Verrucomicrobiae; o__Verrucomicrobiales; f__Verrucomicrobiaceae; g__; s__ 12549.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Synechococcophycideae; o__Pseudanabaenales; f__Pseudanabaenaceae; g__Leptolyngbya; s__ 12049.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Burkholderiales; f__Comamonadaceae 12005.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Methylophilales; f__Methylophilaceae; g__Methylotenera; s__mobilis 11716.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhizobiales; f__Hyphomicrobiaceae; g__Hyphomicrobium; s__ 10033.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__; g__; s__ 9505.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Aeromonadales; f__Aeromonadaceae; g__; s__ 9261.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Xanthomonadales; f__Sinobacteraceae; g__; s__ 8464.0
...
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__Microbacteriaceae; g__Curtobacterium; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__Microbacteriaceae; g__Cryocola; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Chroococcales; f__Chroococcaceae; g__; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Deltaproteobacteria; o__Myxococcales; f__Polyangiaceae; g__Aetherobacter; s__fasciculatus 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Synechococcophycideae; o__Synechococcales; f__Acaryochloridaceae; g__Acaryochloris; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Armatimonadetes; c__Chthonomonadetes; o__Chthonomonadales 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Chroococcales; f__Chroococcaceae; g__Chroococcus; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Bacteroidetes 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Chroococcales; f__Microcystaceae; g__Microcystis; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Verrucomicrobia; c__Opitutae 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Chroococcales; f__Xenococcaceae; g__Chroococcidiopsis; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Oscillatoriales; f__Phormidiaceae; g__Hydrocoleum 2.0
k__Bacteria; p__Armatimonadetes; c__SHA-37; o__; f__; g__; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Oscillatoriophycideae; o__Oscillatoriales; f__Phormidiaceae; g__Planktothrix; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Armatimonadetes; c__Chthonomonadetes; o__Chthonomonadales; f__Chthonomonadaceae; g__Chthonomonas; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Clostridia; o__Thermoanaerobacterales; f__Thermoanaerobacteraceae; g__Moorella; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Verrucomicrobia; c__Opitutae; o__Opitutales; f__Opitutaceae 2.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Rhodocyclales; f__Rhodocyclaceae; g__Rhodocyclus; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Thermoleophilia; o__Solirubrobacterales; f__Conexibacteraceae; g__Conexibacter; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Thermoleophilia; o__Solirubrobacterales; f__Conexibacteraceae 2.0
k__Bacteria; p__Cyanobacteria; c__Synechococcophycideae; o__Synechococcales; f__Acaryochloridaceae 2.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Alphaproteobacteria; o__Rhodospirillales; f__Acetobacteraceae; g__Roseomonas; s__ 2.0
k__Bacteria; p__Planctomycetes; c__Planctomycetia; o__Gemmatales; f__Isosphaeraceae; g__Nostocoida 2.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__Actinosynnemataceae 1.0
k__Bacteria; p__Firmicutes; c__Bacilli; o__Bacillales; f__Bacillaceae; g__Bacillus; s__cereus 1.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Betaproteobacteria; o__Rhodocyclales; f__Rhodocyclaceae; g__Azospira; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Oceanospirillales; f__Halomonadaceae; g__Halomonas; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Proteobacteria; c__Gammaproteobacteria; o__Oceanospirillales; f__Halomonadaceae; g__Halomonas 0.0
k__Bacteria; p__Actinobacteria; c__Actinobacteria; o__Actinomycetales; f__Pseudonocardiaceae; g__Saccharopolyspora; s__ 0.0
k__Bacteria; p__Gemmatimonadetes; c__Gemm-3; o__; f__; g__; s__ 0.0
dtype: float64
In [7]:
open_group.sort_index(inplace=True)
open_group.get_values()
Out[7]:
array([ 2.42180000e+04, 2.00000000e+00, 5.00000000e+00, ...,
1.77000000e+02, 5.25000000e+02, 9.80000000e+01])
In [8]:
org = pd.DataFrame(open_group.get_values(), index=pd.MultiIndex.from_tuples([tuple(x.split(' ')) for x in open_group.index]))
pd.set_option('display.max_rows', len(org))
display(org)
pd.reset_option('display.max_rows')
0
Unassigned
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
24218.0
k__Archaea;
p__Crenarchaeota;
c__MCG;
o__pGrfC26;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Thaumarchaeota;
o__Nitrososphaerales;
f__Nitrososphaeraceae;
g__Candidatus
Nitrososphaera
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
Nitrososphaera;
s__
NaN
NaN
NaN
24.0
s__SCA1145
NaN
NaN
NaN
7.0
s__SCA1170
NaN
NaN
NaN
19.0
s__gargensis
NaN
NaN
NaN
10.0
c__Thermoprotei;
o__Desulfurococcales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__pUWA2;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
p__Euryarchaeota;
c__Methanobacteria;
o__Methanobacteriales;
f__Methanobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
g__Methanobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
46.0
s__bryantii
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Methanobrevibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__Methanomicrobia;
o__Methanocellales;
f__Methanocellaceae;
g__Methanocella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Methanomicrobiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Methanoregulaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Candidatus
Methanoregula;
s__
NaN
NaN
NaN
7.0
o__Methanosarcinales;
f__Methanosaetaceae;
g__Methanosaeta;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Methanosarcinaceae;
g__Methanomethylovorans;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Methanosarcina;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
c__Thermoplasmata;
o__E2;
f__DHVEG-1;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__[Methanomassiliicoccaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
p__[Parvarchaeota];
c__[Parvarchaea];
o__YLA114;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
k__Bacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
97.0
k__Bacteria;
p__;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__AD3;
c__ABS-6;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
c__JG37-AG-4;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__Acidobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
p__Acidobacteria;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
c__AT-s54;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
c__Acidobacteria-5;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
c__Acidobacteria-6;
o__BPC015;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__CCU21;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
278.0
o__iii1-15;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
422.0
f__RB40;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
76.0
f__mb2424;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
384.0
c__Acidobacteriia;
o__Acidobacteriales;
f__Acidobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Koribacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
59.0
g__Candidatus
Koribacter;
s__
NaN
NaN
NaN
17.0
c__BPC102;
o__MVS-40;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
c__DA052;
o__Ellin6513;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
c__Holophagae;
o__Holophagales;
f__Holophagaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
118.0
g__Geothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
46.0
c__PAUC37f;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__RB25;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
c__S035;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
c__Solibacteres;
o__Solibacterales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
49.0
o__Solibacterales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
874.0
f__AKIW659;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Solibacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Candidatus
Solibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
12.0
f__[Bryobacteraceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
58.0
g__Bryobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
c__Sva0725;
o__Sva0725;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
163.0
c__[Chloracidobacteria];
o__11-24;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__DS-100;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__PK29;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
658.0
o__RB41;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
f__Ellin6075;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3484.0
o__[Chloracidobacterales];
f__[Chloracidobacteraceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
36.0
c__iii1-8;
o__32-20;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
o__DS-18;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
32.0
o__SJA-36;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
38.0
p__Actinobacteria;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__Acidimicrobiia;
o__Acidimicrobiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
54.0
o__Acidimicrobiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2552.0
f__AKIW874;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__C111;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2107.0
f__EB1017;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
94.0
f__Iamiaceae;
g__Iamia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
38.0
f__JdFBGBact;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
67.0
f__Microthrixaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
725.0
f__SC3-41;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__ZA3409c;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__koll13;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__ntu14;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
c__Actinobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
c__Actinobacteria;
o__Actinomycetales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
428.0
o__Actinomycetales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9505.0
f__ACK-M1;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Actinomycetaceae;
g__N09;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Actinosynnemataceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
1.0
f__Actinosynnemataceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
54.0
f__Beutenbergiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Cellulomonadaceae;
g__Actinotalea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
g__Cellulomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
64.0
s__xylanilytica
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
g__Demequina;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Corynebacteriaceae;
g__Corynebacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Dietziaceae;
g__Dietzia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Frankiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Geodermatophilaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
f__Geodermatophilaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
38.0
g__Modestobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
f__Intrasporangiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
f__Intrasporangiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
306.0
g__Phycicoccus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
g__Terracoccus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
f__Kineosporiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
45.0
f__Kineosporiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Microbacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2203.0
f__Microbacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
476.0
g__Agromyces;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Candidatus
Aquiluna;
s__rubra
NaN
NaN
NaN
2.0
Rhodoluna;
s__
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Clavibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
g__Cryobacterium;
s__psychrophilum
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
g__Cryocola;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Curtobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Leucobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
45.0
g__Microbacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Mycetocola;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Salinibacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
258.0
g__Yonghaparkia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Micrococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
234.0
g__Arthrobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Arthrobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
48.0
f__Micromonosporaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
f__Micromonosporaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
40.0
g__Actinoplanes;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Pilimelia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Mycobacteriaceae;
g__Mycobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
530.0
s__celatum
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Nakamurellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Nocardiaceae;
g__Rhodococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
s__ruber
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Nocardioidaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Nocardioidaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
901.0
g__Aeromicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Kribbella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Nocardioides;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
32.0
f__Promicromonosporaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
f__Pseudonocardiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
264.0
g__Actinomycetospora;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Pseudonocardia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
69.0
g__Saccharopolyspora;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
0.0
f__Sporichthyaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Sporichthya;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
f__Streptomycetaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
49.0
f__Streptomycetaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Streptomyces
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Streptomyces;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
78.0
s__radiopugnans
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Streptosporangiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Streptosporangiaceae;
g__Sphaerisporangium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Streptosporangium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Bifidobacteriales;
f__Bifidobacteriaceae;
g__Bifidobacterium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
137.0
g__Bifidobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
s__adolescentis
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
s__pseudolongum
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__Micrococcales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__WCHB1-81;
f__At425_EubF1;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__Coriobacteriia;
o__Coriobacteriales;
f__Coriobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__MB-A2-108;
o__0319-7L14;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
95.0
c__OPB41;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
224.0
c__Rubrobacteria;
o__Rubrobacterales;
f__Rubrobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Rubrobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
c__Thermoleophilia;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
o__Gaiellales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
327.0
f__AK1AB1_02E;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
75.0
f__Gaiellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
502.0
o__Solirubrobacterales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
24.0
o__Solirubrobacterales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
471.0
f__Conexibacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Conexibacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
g__Conexibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Patulibacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
140.0
f__Solirubrobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
100.0
p__Aquificae;
c__Aquificae;
o__Aquificales;
f__Aquificaceae;
g__Hydrogenobaculum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
p__Armatimonadetes;
c__0319-6E2;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
c__Armatimonadia;
o__Armatimonadales;
f__Armatimonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
103.0
g__Armatimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
580.0
c__Chthonomonadetes;
o__Chthonomonadales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Chthonomonadales;
f__Chthonomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Chthonomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__SJA-22;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
c__SHA-37;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__SJA-176;
o__GAB-B06;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__RB046;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
c__[Fimbriimonadia];
o__[Fimbriimonadales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
f__[Fimbriimonadaceae]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__[Fimbriimonadaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
107.0
g__Fimbriimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1548.0
p__BHI80-139;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
p__BRC1;
c__PRR-11;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
156.0
p__Bacteroidetes
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__Bacteroidetes;
c__BME43;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
c__Bacteroidia;
o__Bacteroidales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1183.0
f__BA008;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Bacteroidaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Bacteroides;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
s__acidifaciens
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Marinilabiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
38.0
f__Porphyromonadaceae;
g__Dysgonomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
239.0
g__Paludibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
202.0
g__Parabacteroides;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Porphyromonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Prevotellaceae;
g__Prevotella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Rikenellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
197.0
g__Blvii28;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
93.0
g__PW3;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
330.0
f__S24-7;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
65.0
f__SB-1;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
73.0
f__p-2534-18B5;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
c__Cytophagia;
o__Cytophagales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
228.0
f__Cyclobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Cyclobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2327.0
f__Cytophagaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
35.0
f__Cytophagaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
29507.0
g__Adhaeribacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
g__Cytophaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
181.0
g__Dyadobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
g__Emticicia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1901.0
g__Flectobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5541.0
g__Flexibacter;
s__ruber
NaN
NaN
NaN
NaN
126.0
g__Hymenobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
476.0
g__Leadbetterella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4854.0
g__Rhodocytophaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Rudanella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1572.0
g__Runella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4712.0
g__Spirosoma;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
g__Sporocytophaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
132.0
f__Flammeovirgaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
59.0
f__[Amoebophilaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Candidatus
Amoebophilus;
s__
NaN
NaN
NaN
18.0
Cardinium;
s__
NaN
NaN
NaN
10.0
g__SC3-56;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
703.0
c__Flavobacteriia;
o__Flavobacteriales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
48.0
f__Cryomorphaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1613.0
g__Crocinitomix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Fluviicola;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
118.0
f__Flavobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
f__Flavobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
70.0
g__Flavobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6153.0
s__columnare
NaN
NaN
NaN
NaN
59.0
s__gelidilacus
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
s__succinicans
NaN
NaN
NaN
NaN
55.0
g__Gillisia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__[Weeksellaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
76.0
g__Chryseobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
182.0
g__Cloacibacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
g__Ornithobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
c__SM1A07;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
95.0
c__Sphingobacteriia;
o__Sphingobacteriales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2283.0
f__NS11-12;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__Sphingobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
388.0
g__Pedobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
47.0
c__VC2_1_Bac22;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
c__[Rhodothermi];
o__[Rhodothermales];
f__Rhodothermaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Rubricoccus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
c__[Saprospirae];
o__[Saprospirales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
717.0
f__Chitinophagaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
f__Chitinophagaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
29037.0
g__Chitinophaga
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
65.0
g__Chitinophaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Flavihumibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1313.0
g__Flavisolibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
118.0
g__Niabella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Sediminibacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4681.0
g__Segetibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
80.0
f__Saprospiraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
f__Saprospiraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
32600.0
g__Haliscomenobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2477.0
g__Lewinella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
549.0
s__cohaerens
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
p__Caldiserica;
c__OP5;
o__WCHB1-02;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
p__Chlamydiae;
c__Chlamydiia;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
o__Chlamydiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
o__Chlamydiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
76.0
f__Criblamydiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
g__Estrella;
s__lausannensis
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Parachlamydiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
441.0
f__Parachlamydiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
78.0
g__Candidatus
Protochlamydia;
s__
NaN
NaN
NaN
570.0
g__Parachlamydia
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
54.0
g__Parachlamydia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
s__acanthamoebae
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Rhabdochlamydiaceae;
g__Candidatus
Rhabdochlamydia;
s__
NaN
NaN
NaN
239.0
f__Simkaniaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
f__Waddliaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
p__Chlorobi;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__BSV26;
o__A89;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__PK329;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
c__Chlorobia;
o__[Chloroherpetales]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
519.0
o__[Chloroherpetales];
f__SM1B02;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
33.0
c__Ignavibacteria;
o__Ignavibacteriales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Ignavibacteriales;
f__Ignavibacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
94.0
o__SM1H02;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
c__OPB56;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
684.0
c__SJA-28;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
p__Chloroflexi;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
c__Anaerolineae;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
o__A31;
f__S47;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Anaerolineales;
f__Anaerolinaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
83.0
g__Anaerolinea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
g__C1_B004;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__SHD-231;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
g__T78;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__WCHB1-05;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
o__Caldilineales;
f__Caldilineaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Caldilineaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
115.0
g__Caldilinea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
101.0
o__DRC31;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__GCA004;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
o__H39;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
o__S0208;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__SB-34;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__SBR1031;
f__A4b;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
987.0
f__SHA-31;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__SJA-101;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
34.0
o__SHA-20;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
o__SJA-15;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
42.0
o__WCHB1-50;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
313.0
o__envOPS12;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
o__pLW-97;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
c__C0119;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Chloroflexi;
o__Chloroflexales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Chloroflexales;
f__Chloroflexaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
154.0
f__Chloroflexaceae;
g__Chloronema;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
f__FFCH7168;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Oscillochloridaceae;
g__Oscillochloris
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Oscillochloris;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Herpetosiphonales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
o__[Roseiflexales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
216.0
f__[Kouleothrixaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
c__Dehalococcoidetes;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Dehalococcoidales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Dehalococcoidales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Ellin6529;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
714.0
c__Gitt-GS-136;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
c__Ktedonobacteria;
o__Ktedonobacterales;
f__Ktedonobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
o__Thermogemmatisporales;
f__Thermogemmatisporaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
c__S085;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
c__TK10;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
o__AKYG885;
f__Dolo_23;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
o__B07_WMSP1;
f__FFCH4570;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__TK17;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__mle1-48;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
c__Thermomicrobia;
o__JG30-KF-CM45;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
226.0
p__Cyanobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
97.0
p__Cyanobacteria;
c__4C0d-2;
o__MLE1-12;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
o__SM1D11;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
92.0
o__SM2F09;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1637.0
o__YS2;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
89.0
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2084.0
c__Chloroplast;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2595.0
o__Chlorophyta;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
913.0
f__Chlamydomonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3043.0
f__Chlamydomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1503.0
g__Acutodesmus;
s__obliquus
NaN
NaN
NaN
NaN
88.0
g__Chlamydomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Chlamydomonas;
s__applanata
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Spermatozopsis;
s__exsultans
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Trebouxiophyceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Trebouxiophyceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
36.0
g__Coccomyxa
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
o__Cryptophyta;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
70.0
o__Euglenozoa;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Rhodophyta;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
149.0
o__Stramenopiles;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
27731.0
o__Streptophyta;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
370.0
o__UA01;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
30.0
c__Gloeobacterophycideae;
o__Gloeobacterales;
f__Gloeobacteraceae;
g__Gloeobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Gloeobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
47.0
c__ML635J-21;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
198.0
c__Nostocophycideae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
90.0
c__Nostocophycideae;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5040.0
o__Nostocales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Nostocales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Nostocaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7697.0
f__Nostocaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
62551.0
g__Anabaena
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
g__Anabaena;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
s__cylindrica
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
g__Aphanizomenon;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
g__Cylindrospermopsis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
62.0
s__raciborskii
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Dolichospermum
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
448.0
g__Dolichospermum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7452.0
g__Nostoc
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
34.0
g__Nostoc;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2379.0
g__Tolypothrix;
s__distorta
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__Stigonematales;
f__Rivulariaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
91.0
f__Rivulariaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
g__Calothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
65061.0
g__Rivularia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
c__Oscillatoriophycideae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
c__Oscillatoriophycideae;
o__Chroococcales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
51.0
o__Chroococcales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Chroococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Chroococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Cyanobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
8401.0
f__Cyanobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
124.0
g__Cyanobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
g__Rhopalodia;
s__gibba
NaN
NaN
NaN
NaN
251.0
f__Gomphosphaeriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Gomphosphaeriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
f__Microcystaceae;
g__Microcystis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Prochloraceae;
g__Prochloron;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Xenococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
f__Xenococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
203.0
g__Chroococcidiopsis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Oscillatoriales;
f__Phormidiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Phormidiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2852.0
g__Hydrocoleum
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Phormidium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28819.0
s__animale
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
g__Planktothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Synechococcophycideae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
c__Synechococcophycideae;
o__Pseudanabaenales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
o__Pseudanabaenales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1900.0
f__Pseudanabaenaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
196.0
f__Pseudanabaenaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2104.0
g__Arthronema;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
53.0
g__Halomicronema;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Leptolyngbya
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
g__Leptolyngbya;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12049.0
s__frigida
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Pseudanabaena;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
787.0
o__Synechococcales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
691.0
o__Synechococcales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1297.0
f__Acaryochloridaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Acaryochloridaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
76.0
g__Acaryochloris;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Chamaesiphonaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3239.0
f__Synechococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
52.0
f__Synechococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
35.0
g__Paulinella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
40.0
g__Prochlorococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Synechococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4058.0
p__Deferribacteres;
c__Deferribacteres;
o__Deferribacterales;
f__Deferribacteraceae;
g__Mucispirillum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
s__schaedleri
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
p__Elusimicrobia;
c__Elusimicrobia;
o__FAC88;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
o__IIb;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
35.0
o__MVP-88;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Endomicrobia;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__FBP;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
990.0
p__Fibrobacteres;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
c__Fibrobacteria;
o__258ds10;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__TG3;
o__TG3-1;
f__TSCOR003-O20;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
p__Firmicutes
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
63.0
p__Firmicutes;
c__Bacilli
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
c__Bacilli;
o__Bacillales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
244.0
o__Bacillales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
757.0
f__Alicyclobacillaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
g__Alicyclobacillus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__Alicyclobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
79.0
f__Bacillaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
f__Bacillaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
67.0
g__Anaerobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Anoxybacillus;
s__kestanbolensis
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Bacillus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
285.0
g__Bacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5525.0
s__cereus
NaN
NaN
NaN
NaN
1.0
s__firmus
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
s__flexus
NaN
NaN
NaN
NaN
88.0
s__foraminis
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
s__horikoshii
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__muralis
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Natronobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Paenibacillaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
33.0
g__Ammoniphilus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
g__Aneurinibacillus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Brevibacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__reuszeri
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Cohnella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
g__Paenibacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
284.0
s__chondroitinus
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
s__macerans
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Planococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Planococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
225.0
g__Lysinibacillus;
s__boronitolerans
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Paenisporosarcina;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Planococcus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Planomicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Solibacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Sporosarcina
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Sporosarcina;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
39.0
f__Sporolactobacillaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Thermoactinomycetaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
24.0
f__Thermoactinomycetaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
g__Planifilum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Shimazuella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__[Exiguobacteraceae]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
49.0
f__[Exiguobacteraceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5799.0
g__Exiguobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
33561.0
o__Lactobacillales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__Lactobacillales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
f__Aerococcaceae;
g__Aerococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
329.0
f__Carnobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
f__Carnobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
43.0
g__Carnobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1165.0
g__Trichococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Enterococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
138.0
f__Enterococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Enterococcus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Enterococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
66.0
s__casseliflavus
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Melissococcus;
s__plutonius
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Lactobacillaceae;
g__Lactobacillus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Lactobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
65.0
s__reuteri
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
f__Leuconostocaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
100.0
g__Weissella
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
872.0
f__Streptococcaceae;
g__Lactococcus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
43.0
g__Lactococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
111.0
s__garvieae
NaN
NaN
NaN
NaN
1375.0
o__Turicibacterales;
f__Turicibacteraceae;
g__Turicibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
64.0
c__Clostridia;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Clostridiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
60.0
o__Clostridiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
288.0
f__Caldicoprobacteraceae;
g__Caldicoprobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Christensenellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
39.0
f__Clostridiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Clostridiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
186.0
g__Caloramator;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
g__Candidatus
Arthromitus;
s__
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Clostridium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
99.0
g__Clostridium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
906.0
s__acidurici
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
s__bowmanii
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
s__neonatale
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__perfringens
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Oxobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Proteiniclasticum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Tindallia_Anoxynatronum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Dehalobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Dehalobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Eubacteriaceae;
g__Acetobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Anaerofustis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Gracilibacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
67.0
g__Gracilibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__JTB215;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
71.0
f__Lachnospiraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__Lachnospiraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
198.0
g__Anaerostipes;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Coprococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
g__Epulopiscium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__Peptococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
96.0
f__Peptococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
29.0
g__Dehalobacter_Syntrophobotulus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Desulfosporosinus;
s__meridiei
NaN
NaN
NaN
NaN
194.0
g__Desulfotomaculum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Desulfurispora;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Pelotomaculum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__WCHB1-84;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Peptostreptococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
41.0
f__Peptostreptococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
610.0
f__Ruminococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
642.0
g__Ethanoligenens;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
g__Faecalibacterium;
s__prausnitzii
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Oscillospira;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Ruminococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
s__flavefaciens
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Syntrophomonadaceae;
g__Syntrophomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Veillonellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Veillonellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
117.0
g__Pelosinus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
51.0
g__Sporomusa;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
s__polytropa
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__[Acidaminobacteraceae];
g__Fusibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
88.0
f__[Mogibacteriaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
67.0
g__Anaerovorax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
34.0
f__[Tissierellaceae]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__[Tissierellaceae];
g__Sedimentibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__OPB54;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
o__Thermoanaerobacterales;
f__Thermoanaerobacteraceae;
g__Moorella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Erysipelotrichi;
o__Erysipelotrichales;
f__Erysipelotrichaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Allobaculum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Bulleidia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Erysipelothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__PSB-M-3;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
p__Fusobacteria;
c__Fusobacteriia;
o__Fusobacteriales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Fusobacteriaceae;
g__Cetobacterium;
s__somerae
NaN
NaN
NaN
NaN
441.0
g__Fusobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__u114;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Leptotrichiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
p__GN02;
c__3BR-5F;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
c__BB34;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
c__BD1-5;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
273.0
c__GKS2-174;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__GN07;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
p__GN04;
c__GN15;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
50.0
p__GOUTA4;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
p__Gemmatimonadetes;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Gemm-1;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
534.0
c__Gemm-3;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
0.0
c__Gemm-5;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Gemmatimonadetes
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Gemmatimonadetes;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
60.0
o__Gemmatimonadales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__A1-B1;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2322.0
f__Ellin5301;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__Gemmatimonadaceae;
g__Gemmatimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1217.0
o__KD8-87;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
o__N1423WL;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
33.0
p__NC10;
c__12-24;
o__JH-WHS47;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__NKB19;
c__TSBW08;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
39.0
p__Nitrospirae;
c__Nitrospira;
o__Nitrospirales;
f__0319-6A21;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__FW;
g__4-29;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Nitrospiraceae;
g__JG37-AG-70;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Nitrospira;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
147.0
f__[Thermodesulfovibrionaceae];
g__GOUTA19;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__HB118;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__LCP-6;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
p__OC31;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__OD1;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
c__ABY1;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
c__Mb-NB09;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
c__SM2F11;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
148.0
c__ZB2;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
116.0
p__OP11;
c__WCHB1-64;
o__d153;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
p__OP3;
c__BD4-9;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__OP8;
c__OP8_2;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
p__OP9;
c__JS1;
o__SB-45;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__Planctomycetes;
c__028H05-P-BN-P5;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
c__C6;
o__MVS-107;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__d113;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
c__OM190;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
o__CL500-15;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
180.0
o__agg27;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
c__Phycisphaerae;
o__AKAU3564;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
o__CCM11a;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__MSBL9;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Phycisphaerales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
624.0
o__Pla1;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__S-70;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__WD2101;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
976.0
o__mle1-8;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
c__Pla3;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
c__Planctomycetia;
o__B97;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
91.0
o__Gemmatales;
f__Gemmataceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Gemmataceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2586.0
g__Gemmata;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16091.0
f__Isosphaeraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
927.0
g__Isosphaera;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Nostocoida
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Pirellulales;
f__Pirellulaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Pirellulaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26720.0
g__A17;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
381.0
g__Pirellula;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
548.0
o__Planctomycetales;
f__Planctomycetaceae;
g__Planctomyces;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4586.0
c__vadinHA49;
o__DH61;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
427.0
o__PeHg47;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
33.0
o__p04_C01;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
p__Proteobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
68.0
p__Proteobacteria;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
38.0
c__Alphaproteobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
296.0
c__Alphaproteobacteria;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5853.0
o__BD7-3;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1985.0
o__Caulobacterales;
f__Caulobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
f__Caulobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
220.0
g__Asticcacaulis
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__Asticcacaulis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1345.0
s__biprosthecium
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
g__Caulobacter;
s__henricii
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
g__Mycoplana;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
503.0
g__Phenylobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
355.0
o__Ellin329;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
81.0
o__Kiloniellales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Kiloniellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__RF32;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Rhizobiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6380.0
o__Rhizobiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
64180.0
f__Aurantimonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
f__Aurantimonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
50.0
f__Beijerinckiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
361.0
f__Bradyrhizobiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
45.0
f__Bradyrhizobiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
384.0
g__Balneimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
g__Bosea;
s__genosp.
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
g__Bradyrhizobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
50.0
f__Brucellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
f__Brucellaceae;
g__Ochrobactrum
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Ochrobactrum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
384.0
f__Cohaesibacteraceae;
g__Cohaesibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
f__Hyphomicrobiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
683.0
f__Hyphomicrobiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2051.0
g__Devosia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2861.0
g__Hyphomicrobium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
52.0
g__Hyphomicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10033.0
s__sulfonivorans
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
g__Pedomicrobium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Pedomicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
502.0
g__Rhodobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Rhodoplanes
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Rhodoplanes;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1511.0
s__elegans
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
f__Methylobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Methylobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Methylobacterium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Methylobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
s__adhaesivum
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
s__organophilum
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Methylocystaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
24.0
f__Methylocystaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1881.0
g__Methylopila;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
77.0
g__Methylosinus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
72.0
g__Pleomorphomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
342.0
f__Phyllobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
395.0
f__Phyllobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2652.0
g__Mesorhizobium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Mesorhizobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
g__Phyllobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
f__Rhizobiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
244.0
f__Rhizobiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3026.0
g__Agrobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1907.0
g__Kaistia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
g__Rhizobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__leguminosarum
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Shinella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
f__Rhodobiaceae;
g__Afifella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
179.0
f__Xanthobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
61.0
f__Xanthobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
60.0
g__Blastochloris;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
g__Labrys;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
79.0
o__Rhodobacterales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
358.0
o__Rhodobacterales;
f__Hyphomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6947.0
g__Hyphomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2080.0
f__Rhodobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3271.0
f__Rhodobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8000.0
g__Amaricoccus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Anaerospora
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Anaerospora;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13689.0
g__Paracoccus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
33.0
g__Paracoccus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
g__Phaeobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Rhodobaca;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Rhodobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
g__Rhodobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
218343.0
s__sphaeroides
NaN
NaN
NaN
NaN
42.0
g__Rhodovulum
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
g__Rhodovulum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
36.0
g__Rubellimicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
o__Rhodospirillales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
21.0
o__Rhodospirillales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
273.0
f__Acetobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
f__Acetobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7922.0
g__Roseococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4593.0
g__Roseomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__mucosa
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Rhodospirillaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
724.0
f__Rhodospirillaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3321.0
g__Azospirillum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
211.0
s__amazonense
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Inquilinus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
g__Rhodospirillum
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
30.0
g__Skermanella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
o__Rickettsiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2145.0
f__Holosporaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Rickettsiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
412.0
g__Rickettsia
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Rickettsia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
311.0
s__Rickettsia
endosymbiont
of
Deronectes
platynotus
2.0
f__mitochondria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
f__mitochondria;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
772.0
g__Pythium;
s__ultimum
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Thalassiosira;
s__pseudonana
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Sphingomonadales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
919.0
o__Sphingomonadales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
69654.0
f__Erythrobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5249.0
f__Erythrobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15187.0
g__Erythromicrobium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Lutibacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
43.0
f__Sphingomonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
675.0
f__Sphingomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18844.0
g__Blastomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
95.0
g__Kaistobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
910.0
g__Novosphingobium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
377.0
g__Novosphingobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5193.0
g__Sphingobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
47.0
g__Sphingomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
g__Sphingomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
689.0
s__changbaiensis
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
s__echinoides
NaN
NaN
NaN
NaN
36.0
s__suberifaciens
NaN
NaN
NaN
NaN
323.0
s__wittichii
NaN
NaN
NaN
NaN
139.0
g__Sphingopyxis
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
g__Sphingopyxis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2895.0
s__alaskensis
NaN
NaN
NaN
NaN
8464.0
g__Zymomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
29645.0
c__Betaproteobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
817.0
c__Betaproteobacteria;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
916.0
o__A21b;
f__EB1003;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
f__UD5;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
o__Burkholderiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2374.0
o__Burkholderiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3378.0
f__Alcaligenaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
140.0
f__Alcaligenaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
974.0
g__Achromobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
g__Pigmentiphaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1798.0
f__Burkholderiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Burkholderiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
59.0
g__Burkholderia
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
100.0
g__Burkholderia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
s__andropogonis
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__bryophila
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Comamonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
12005.0
f__Comamonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23840.0
g__Acidovorax
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
g__Acidovorax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
s__delafieldii
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
s__facilis
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Comamonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
g__Delftia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
24.0
g__Hydrogenophaga;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3792.0
g__Leptothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1631.0
g__Limnobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Limnohabitans;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5923.0
g__Methylibium
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
37.0
g__Methylibium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
117.0
g__Paucibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Polaromonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
47.0
g__RS62;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
29.0
g__Ramlibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
42.0
g__Rhodoferax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
61.0
g__Roseateles;
s__depolymerans
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Rubrivivax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
116.0
s__gelatinosus
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Thiomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__Variovorax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Oxalobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
141.0
f__Oxalobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17188.0
g__Herminiimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Janthinobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
s__lividum
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Oxalobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Oxalobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
g__Polynucleobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Polynucleobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
97.0
s__cosmopolitanus
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Ralstonia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
o__Ellin6067;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3112.0
o__Gallionellales;
f__Gallionellaceae;
g__Gallionella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
o__Hydrogenophilales;
f__Hydrogenophilaceae;
g__Thiobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
212.0
o__IS-44;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
35.0
o__MND1;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
185.0
o__Methylophilales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
314.0
o__Methylophilales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
90.0
f__Methylophilaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
377.0
f__Methylophilaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2273.0
g__Methylotenera;
s__mobilis
NaN
NaN
NaN
NaN
11716.0
o__Neisseriales;
f__Neisseriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
30.0
f__Neisseriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
316.0
g__Chromobacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__Deefgea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
924.0
g__Eikenella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Microvirgula
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Vitreoscilla;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
g__Vogesella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
86.0
o__Nitrosomonadales;
f__Nitrosomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
o__Procabacteriales;
f__Procabacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
149.0
g__Procabacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Rhodocyclales;
f__Rhodocyclaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
614.0
f__Rhodocyclaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3675.0
g__Azoarcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
61.0
g__Azospira;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
0.0
g__Candidatus
Accumulibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
160.0
g__Dechloromonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1703.0
g__Dok59;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
40.0
g__K82;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__Propionivibrio;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
525.0
g__Rhodocyclus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Sulfuritalea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
108.0
g__Thauera;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
g__Uliginosibacterium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
30.0
g__Z-35;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
139.0
g__Zoogloea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
o__SBla14;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
92.0
o__SC-I-84;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1779.0
o__Thiobacterales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Thiobacterales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
193.0
c__Deltaproteobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
c__Deltaproteobacteria;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
493.0
o__AF420338;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__BPC076;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
o__Bdellovibrionales;
f__Bacteriovoracaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
827.0
g__Bacteriovorax;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
f__Bdellovibrionaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Bdellovibrio;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1629.0
s__bacteriovorus
NaN
NaN
NaN
NaN
90.0
o__Desulfarculales;
f__Desulfarculaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
45.0
o__Desulfobacterales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
o__Desulfobacterales;
f__Desulfobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
g__Desulfococcus
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Desulfococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
36.0
f__Desulfobulbaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Desulfobulbaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
832.0
g__Desulfobulbus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
335.0
g__Desulfocapsa;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__Desulfovibrionales;
f__Desulfomicrobiaceae;
g__Desulfomicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
79.0
f__Desulfovibrionaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
168.0
g__Desulfovibrio;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
s__mexicanus
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
s__putealis
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
o__Desulfuromonadales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
o__Desulfuromonadales;
f__Desulfuromonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
81.0
f__Geobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Geobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
g__Geobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
608.0
f__Pelobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
o__FAC87;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1050.0
o__GMD14H09;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
46.0
o__GW-28;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__MBNT15;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
o__MIZ46;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
210.0
o__Myxococcales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Myxococcales;
f__0319-6G20;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
20.0
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1428.0
f__Cystobacterineae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
f__Haliangiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
371.0
g__Haliangium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
19.0
f__Myxococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Anaeromyxobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
210.0
f__Nannocystaceae;
g__Nannocystis
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Nannocystis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
115.0
g__Plesiocystis;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
486.0
f__OM27;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
f__Polyangiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Polyangiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
106.0
g__Aetherobacter;
s__fasciculatus
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Chondromyces;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
50.0
o__NB1-j;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
81.0
f__JTB38;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
f__MND4;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__NB1-i;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
o__PB19;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
o__Spirobacillales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1349.0
o__Syntrophobacterales;
f__Syntrophaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
g__Desulfobacca;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
89.0
g__Desulfomonile;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
g__Syntrophus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
f__Syntrophobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
f__Syntrophobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
398.0
g__Syntrophobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
26.0
f__Syntrophorhabdaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
37.0
o__[Entotheonellales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
15.0
f__[Entotheonellaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Epsilonproteobacteria;
o__Campylobacterales;
f__Campylobacteraceae;
g__Arcobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
62.0
g__Sulfurospirillum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
f__Helicobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
g__Sulfuricurvum;
s__kujiense
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
c__Gammaproteobacteria
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
209.0
c__Gammaproteobacteria;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
78.0
o__Acidithiobacillales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6603.0
o__Aeromonadales;
f__Aeromonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
63.0
f__Aeromonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9261.0
g__Aeromonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
o__Alteromonadales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
o__Alteromonadales;
f__125ds10;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
f__211ds20;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
f__Alteromonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
86.0
f__Alteromonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
g__Cellvibrio;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
163.0
g__Marinobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__OM60;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2499.0
f__Shewanellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Shewanellaceae;
g__Shewanella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
f__[Chromatiaceae];
g__Alkalimonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Rheinheimera;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
65.0
o__Chromatiales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
o__Chromatiales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
299.0
f__Chromatiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Chromatiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
177.0
g__Allochromatium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Halochromatium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Thiocapsa
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Thiodictyon
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Halothiobacillaceae;
g__Halothiobacillus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
o__Enterobacteriales;
f__Enterobacteriaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
93.0
f__Enterobacteriaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1280.0
g__Citrobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Erwinia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Plesiomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
g__Plesiomonas;
s__shigelloides
NaN
NaN
NaN
NaN
46.0
g__Serratia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
187.0
g__Yersinia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__HOC36;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2112.0
o__HTCC2188;
f__HTCC2089;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
414.0
o__Legionellales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
o__Legionellales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1764.0
f__Coxiellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Coxiellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2647.0
g__Aquicella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
798.0
g__Coxiella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Rickettsiella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__Francisellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
f__Legionellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
f__Legionellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
407.0
g__Legionella
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
g__Legionella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1289.0
g__Tatlockia
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Tatlockia;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
44.0
o__Methylococcales
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
10.0
o__Methylococcales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__Crenotrichaceae;
g__Crenothrix
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
148.0
g__Crenothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1281.0
f__Methylococcaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Methylococcaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
45.0
g__Methylocaldum;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
49.0
g__Methylomicrobium;
s__agile
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Methylomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
o__Oceanospirillales;
f__Hahellaceae;
g__Hahella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Halomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
g__Halomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
0.0
g__Halomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
0.0
f__Oceanospirillaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Oleiphilaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
f__Saccharospirillaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Pasteurellales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
o__Pseudomonadales;
f__Moraxellaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Moraxellaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
121.0
g__Acinetobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
311.0
s__johnsonii
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
s__rhizosphaerae
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
g__Enhydrobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Perlucidibaca;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
f__Pseudomonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__Pseudomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
g__Pseudomonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
760.0
s__viridiflava
NaN
NaN
NaN
NaN
32.0
o__Thiohalorhabdales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Thiotrichales;
f__Piscirickettsiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
831.0
f__Thiotrichaceae;
g__Thiothrix;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
52.0
o__Xanthomonadales;
f__Sinobacteraceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Sinobacteraceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8464.0
g__Steroidobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
f__Xanthomonadaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
309.0
f__Xanthomonadaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
16071.0
g__Aquimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
g__Arenimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
231.0
g__Dokdonella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
103.0
g__Luteibacter;
s__rhizovicinus
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Luteimonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Luteimonas;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
622.0
g__Lysobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Lysobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
90.0
s__brunescens
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
g__Thermomonas
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
16.0
o__[Marinicellales];
f__[Marinicellaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
190.0
c__TA18;
o__CV90;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
438.0
o__PHOS-HD29;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1591.0
c__Zetaproteobacteria;
o__Mariprofundales;
f__Mariprofundaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__SBR1093;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
p__SC4;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__SR1;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
239.0
p__Spirochaetes;
c__MVP-15;
o__PL-11B10;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
c__Spirochaetes;
o__Spirochaetales;
f__Spirochaetaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
g__Spirochaeta
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Spirochaeta;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
s__aurantia
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
g__Treponema;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
c__[Leptospirae];
o__[Leptospirales];
f__Leptospiraceae;
g__Leptonema;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
g__Leptospira;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
s__biflexa
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Turneriella;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
39.0
f__Sediment-4;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__SJA-88;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
17.0
p__Synergistetes;
c__Synergistia;
o__Synergistales;
f__Dethiosulfovibrionaceae;
g__TG5;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
f__Synergistaceae;
g__Candidatus
Tammella;
s__
NaN
NaN
NaN
19.0
p__TM6;
c__F38;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__SBRH58;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
32.0
c__SJA-4;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
553.0
o__S1198;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
27.0
o__YJF2-48;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__TM7;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
c__SC3;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
c__TM7-1;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
23.0
c__TM7-3;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__Tenericutes;
c__CK-1C4-19;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
276.0
c__Mollicutes;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
91.0
o__Entomoplasmatales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__Mycoplasmatales;
f__Mycoplasmataceae;
g__Mycoplasma;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
o__RF39;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
7.0
o__RsaHF231;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
96.0
p__Verrucomicrobia
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
p__Verrucomicrobia;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
24.0
c__Opitutae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
c__Opitutae;
o__Opitutales;
f__Opitutaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
f__Opitutaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
173.0
g__Opitutus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1873.0
o__Puniceicoccales;
f__Puniceicoccaceae;
g__Coraliomargarita;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
9.0
o__[Cerasicoccales];
f__[Cerasicoccaceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
84.0
c__Verruco-5;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
o__LD1-PB3;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
110.0
o__WCHB1-41;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
48.0
f__RFP12;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12.0
c__Verrucomicrobiae;
o__Verrucomicrobiales;
f__Verrucomicrobiaceae
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
56.0
f__Verrucomicrobiaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
12549.0
g__Akkermansia;
s__muciniphila
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
g__Luteolibacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
25952.0
g__MSBL3;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
14.0
g__Prosthecobacter
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
g__Prosthecobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
579.0
s__debontii
NaN
NaN
NaN
NaN
146.0
g__Rubritalea;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
186.0
g__Verrucomicrobium;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1151.0
c__[Methylacidiphilae];
o__Methylacidiphilales;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
18.0
f__LD19;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
114.0
o__S-BQ2-57;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
c__[Pedosphaerae];
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
o__[Pedosphaerales]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
25.0
o__[Pedosphaerales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
210.0
f__Ellin515;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
127.0
f__Ellin517;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
22.0
f__R4-41B;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1118.0
f__[Pedosphaeraceae];
g__Pedosphaera;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
f__auto67_4W;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
169.0
c__[Spartobacteria];
o__[Chthoniobacterales];
f__01D2Z36;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
13.0
f__[Chthoniobacteraceae]
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
NaN
90.0
f__[Chthoniobacteraceae];
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2526.0
g__Candidatus
Xiphinematobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
2755.0
g__Chthoniobacter;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
1517.0
g__DA101;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
369.0
g__OR-59;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
8.0
g__heteroC45_4W;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
57.0
p__WPS-2;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
154.0
p__WS1;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
6.0
p__WS3;
c__PRR-12;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
5.0
o__GN03;
f__KSB4;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
4.0
o__Sediment-1;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
f__PRR-10;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
31.0
p__WS5;
c__;
o__;
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
p__WWE1;
c__[Cloacamonae];
o__[Cloacamonales];
f__;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
3.0
f__SHA-116;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
2.0
p__[Thermi];
c__Deinococci;
o__Deinococcales;
f__Deinococcaceae;
g__CM44;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
459.0
g__Deinococcus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
28.0
f__Trueperaceae;
g__;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
11.0
g__B-42;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
177.0
g__Truepera;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
525.0
o__Thermales;
f__Thermaceae;
g__Meiothermus;
s__
NaN
NaN
NaN
NaN
98.0
In [20]:
org.index.names = [i for i in range(len(org.index.names))]
org.groupby(level=[0, 1]).sum().sort_values(0, ascending=False)
Out[20]:
0
0
1
k__Bacteria;
p__Proteobacteria;
724791.0
p__Cyanobacteria;
259241.0
p__Bacteroidetes;
137957.0
p__Firmicutes;
56035.0
p__Planctomycetes;
54432.0
p__Verrucomicrobia;
52135.0
p__Actinobacteria;
23970.0
p__Acidobacteria;
7021.0
p__Gemmatimonadetes;
4225.0
p__Chloroflexi;
3421.0
p__Armatimonadetes;
2428.0
p__Chlamydiae;
1545.0
p__Chlorobi;
1461.0
p__[Thermi];
1298.0
p__FBP;
990.0
p__TM6;
618.0
p__Tenericutes;
474.0
p__Fusobacteria;
457.0
p__GN02;
298.0
p__OD1;
293.0
p__SR1;
239.0
p__Nitrospirae;
213.0
p__BRC1;
156.0
p__WPS-2;
154.0
k__Archaea;
p__Euryarchaeota;
137.0
k__Bacteria;
p__Spirochaetes;
106.0
p__Cyanobacteria
97.0
k__Archaea;
p__Crenarchaeota;
75.0
k__Bacteria;
p__Proteobacteria
68.0
p__WS3;
68.0
p__Firmicutes
63.0
p__GN04;
50.0
p__Elusimicrobia;
48.0
p__TM7;
40.0
p__NKB19;
39.0
p__Synergistetes;
33.0
p__Deferribacteres;
30.0
p__Fibrobacteres;
26.0
p__WS5;
11.0
p__BHI80-139;
8.0
p__OP8;
7.0
p__WS1;
6.0
p__AD3;
5.0
p__Aquificae;
5.0
p__WWE1;
5.0
k__Archaea;
p__[Parvarchaeota];
4.0
k__Bacteria;
p__SBR1093;
4.0
p__OP11;
4.0
p__Acidobacteria
3.0
p__Caldiserica;
3.0
p__Verrucomicrobia
3.0
p__GOUTA4;
3.0
p__SC4;
2.0
p__Bacteroidetes
2.0
p__;
2.0
p__OP9;
2.0
p__OP3;
2.0
p__OC31;
2.0
p__NC10;
2.0
Content source: tiagoantao/MARC
Similar notebooks: