In [1]:
import sys
sys.path.append("../codes/")
from Readfiles import getFnames
from DCdata import readReservoirDC_all
%pylab inline
/Users/sgkang/anaconda/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/font_manager.py:273: UserWarning: Matplotlib is building the font cache using fc-list. This may take a moment.
warnings.warn('Matplotlib is building the font cache using fc-list. This may take a moment.')
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib
In [ ]:
In [ ]:
In [4]:
directory = "../data/ChungCheonDC/"
fnames = getFnames(directory, dtype="apr", minimumsize=7000.)
fname_temp = fnames[0]
dat_temp,height_temp, ndata = readReservoirDC_all(fname_temp)
---------------------------------------------------------------------------
IOError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-4-4af1ed5c3a36> in <module>()
2 fnames = getFnames(directory, dtype="apr", minimumsize=7000.)
3 fname_temp = fnames[0]
----> 4 dat_temp,height_temp, ndata = readReservoirDC_all(fname_temp)
/Users/sgkang/Projects/DamGeophysics/codes/DCdata.pyc in readReservoirDC_all(fname)
37
38 def readReservoirDC_all(fname):
---> 39 f = open(fname, 'r')
40 data = f.readlines()
41 temp = data[3].split()
IOError: [Errno 2] No such file or directory: '20150101000000.apr'
In [ ]:
In [5]:
DATA.shape
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-5-dc97ee9dc9b5> in <module>()
----> 1 DATA.shape
NameError: name 'DATA' is not defined
In [6]:
ntimes = len(fnames)
DATA = np.zeros((dat_temp.shape[0], ntimes))*np.nan
height = np.ones(ntimes)*np.nan
for i, fname in enumerate(fnames):
dat_temp,height_temp, ndata = readReservoirDC_all(fname)
if dat_temp.shape[0] == 380:
DATA[:,i] = dat_temp[:,-1]
height[i] = height_temp[0]
else:
print fname,dat_temp.shape[0], ndata
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-6-c6609f8ae9d3> in <module>()
1 ntimes = len(fnames)
----> 2 DATA = np.zeros((dat_temp.shape[0], ntimes))*np.nan
3 height = np.ones(ntimes)*np.nan
4 for i, fname in enumerate(fnames):
5 dat_temp,height_temp, ndata = readReservoirDC_all(fname)
NameError: name 'dat_temp' is not defined
In [7]:
a = ['1', '2', '3']
In [8]:
def strtofloat(input):
temp = ""
for i in input:
temp += i
return float(temp)
In [9]:
# dat_temp,height_temp, datalist = readReservoirDC_all(fnames[79])
# print fnames[79]
# # datalist = readReservoirDC_all(fnames[79])
In [10]:
print fnames[79]
20150120120000.apr
In [ ]:
In [ ]:
In [11]:
from ipywidgets import interact, IntSlider
In [ ]:
In [12]:
from scipy import interpolate
x = np.linspace(mid.min(), mid.max(), 100)
z = np.linspace(dz.min(), dz.max(), 100)
# grid_x, grid_z = np.mgrid[np.min(mid):np.max(mid), np.min(dz):np.max(dz)]
grid_x, grid_z = np.meshgrid(x,z)
def vizDCtimeSeries(idatum, itime):
# idatum = 0
figsize(8,6)
fig = plt.figure()
ax1 = plt.subplot(211)
ax2 = plt.subplot(212)
# ax1.plot(mid, dz, '.')
grid_rho = griddata(mid, dz, DATA[:,itime], grid_x, grid_z, interp='linear')
grid_rho = grid_rho.reshape(grid_x.shape)
vmin, vmax = 50, 200.
ax1.contourf(grid_x, grid_z, grid_rho, 100, vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax), cmap="jet")
ax1.contourf(grid_x, grid_z, grid_rho, 100, vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax), cmap="jet")
ax1.scatter(mid, dz, s=20, c = DATA[:,itime], edgecolor="None", vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax))
# ax1.plot(grid_x.flatten(), grid_z.flatten(), 'k.')
ax1.plot(mid[idatum], dz[idatum], 'ro')
ax2.plot(DATA[idatum,:], 'k-', lw=2)
ax2.set_yscale('log')
ax2.set_ylim(vmin, vmax)
ax2_1 = ax2.twinx()
ax2_1.plot(height)
ax2_1.set_ylim(15, 21.)
ax2_1.plot(np.r_[itime, itime], np.r_[15, 21.], 'k--', lw=1)
ax1.text(0,0, fnames[itime])
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-b42d0b1b4b77> in <module>()
1 from scipy import interpolate
----> 2 x = np.linspace(mid.min(), mid.max(), 100)
3 z = np.linspace(dz.min(), dz.max(), 100)
4 # grid_x, grid_z = np.mgrid[np.min(mid):np.max(mid), np.min(dz):np.max(dz)]
5 grid_x, grid_z = np.meshgrid(x,z)
NameError: name 'mid' is not defined
In [13]:
interact(vizDCtimeSeries, idatum=IntSlider(min=0, max=300, step=10, value=0),
itime=IntSlider(min=0, max=DATA.shape[1]-1, step=100, value=0))
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-13-6622a73ea5e4> in <module>()
----> 1 interact(vizDCtimeSeries, idatum=IntSlider(min=0, max=300, step=10, value=0),
2 itime=IntSlider(min=0, max=DATA.shape[1]-1, step=100, value=0))
NameError: name 'vizDCtimeSeries' is not defined
In [ ]:
In [14]:
def vizDCtimeSeriesVariation(idatum, itime):
# idatum = 0
figsize(8,6)
fig = plt.figure()
ax1 = plt.subplot(211)
ax2 = plt.subplot(212)
# ax1.plot(mid, dz, '.')
itime_ref = 790
DATA_ref = DATA[:,itime_ref]
grid_rho = griddata(mid, dz, DATA[:,itime]/DATA_ref, grid_x, grid_z, interp='linear')
grid_rho = grid_rho.reshape(grid_x.shape)
vmin, vmax = 0.9, 1.1
ax1.contourf(grid_x, grid_z, grid_rho, 100, vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax), cmap="jet")
ax1.contourf(grid_x, grid_z, grid_rho, 100, vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax), cmap="jet")
ax1.scatter(mid, dz, s=20, c = DATA[:,itime]/DATA_ref, edgecolor="None", vmin =vmin, vmax = vmax, clim=(vmin, vmax))
# ax1.plot(grid_x.flatten(), grid_z.flatten(), 'k.')
ax1.plot(mid[idatum], dz[idatum], 'ro')
ax2.plot(DATA[idatum,:], 'k-', lw=2)
ax2.set_yscale('log')
vmin, vmax = 50., 200.
ax2.set_ylim(vmin, vmax)
ax2_1 = ax2.twinx()
ax2_1.plot(height)
ax2_1.set_ylim(15, 21.)
ax2_1.plot(np.r_[itime, itime], np.r_[15, 21.], 'k--', lw=1)
ax1.text(0,0, fnames[itime])
In [15]:
interact(vizDCtimeSeriesVariation, idatum=IntSlider(min=0, max=300, step=10, value=0),
itime=IntSlider(min=0, max=DATA.shape[1]-1, step=4, value=0))
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-15-d7ac00b9e765> in <module>()
1 interact(vizDCtimeSeriesVariation, idatum=IntSlider(min=0, max=300, step=10, value=0),
----> 2 itime=IntSlider(min=0, max=DATA.shape[1]-1, step=4, value=0))
NameError: name 'DATA' is not defined
In [16]:
DATA.shape
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-16-dc97ee9dc9b5> in <module>()
----> 1 DATA.shape
NameError: name 'DATA' is not defined
In [17]:
x = np.linspace(mid.min(), mid.max(), 100)
z = np.linspace(dz.min(), dz.max(), 40)
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-17-6a999cae2a44> in <module>()
----> 1 x = np.linspace(mid.min(), mid.max(), 100)
2 z = np.linspace(dz.min(), dz.max(), 40)
NameError: name 'mid' is not defined
In [22]:
print z.min(), z.max()
print x.min(), x.max()
-18.0 -4.0
5.0 105.0
In [23]:
np.diff(x)
Out[23]:
array([ 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101,
1.01010101, 1.01010101, 1.01010101, 1.01010101])
In [24]:
from SimPEG import Mesh
from scipy import interpolate
In [25]:
hx = np.ones(110)*1.
hy = np.ones(40)*0.5
mesh2D = Mesh.TensorMesh([hx,hy], x0 = '0N')
In [26]:
len(range(90,900,4))
Out[26]:
203
In [27]:
timeind = range(0,1200,16)
model = np.zeros((mesh2D.nC,len(timeind)))
hz = np.ones(len(timeind))
mesh = Mesh.TensorMesh([hx,hy,hz], x0 = '0N0')
itime_ref = 790
DATA_ref = DATA[:,itime_ref]
model_ratio = model.copy()
for i, itime in enumerate(timeind) :
print itime
F = interpolate.LinearNDInterpolator(np.c_[mid, dz], DATA[:,itime])
F_ratio = interpolate.LinearNDInterpolator(np.c_[mid, dz], abs(DATA[:,itime]-DATA_ref)/abs(DATA_ref))
model_ratio[:,i] = F_ratio(mesh2D.gridCC)
model[:,i] = F(mesh2D.gridCC)
0
16
32
48
64
80
96
112
128
144
160
176
192
208
224
240
256
272
288
304
320
336
352
368
384
400
416
432
448
464
480
496
512
528
544
560
576
592
608
624
640
656
672
688
704
720
736
752
768
784
800
816
832
848
864
880
896
912
928
944
960
976
992
1008
1024
1040
1056
1072
1088
1104
1120
1136
1152
1168
1184
In [28]:
model.shape
Out[28]:
(4400L, 75L)
In [29]:
from SimPEG import Utils
In [30]:
Model = Utils.mkvc(model[:,::-1])
Model_ratio = Utils.mkvc(model_ratio[:,::-1])
In [31]:
Model[np.isnan(Model)] = 1e-8
Model_ratio[np.isnan(Model_ratio)] = 1e-8
In [32]:
mesh.writeModelUBC("./dammodel.txt", Model)
mesh.writeModelUBC("./dammodel_ratio.txt", Model_ratio)
In [33]:
mesh.writeUBC("./dammodel_mesh.txt")
In [34]:
!dir
C 드라이브의 볼륨: TI30939900A
볼륨 일련 번호: 306C-36FB
C:\Users\sungkeun\Documents\DamGeophysics\data\ChungCheonDC 디렉터리
2016-03-18 오후 05:47 <DIR> .
2016-03-18 오후 05:47 <DIR> ..
2015-05-28 오후 10:12 8,085 20150101000000.apr
2015-05-28 오후 10:12 8,087 20150101060000.apr
2015-05-28 오후 10:13 8,071 20150101120000.apr
2015-05-28 오후 10:13 8,080 20150101180000.apr
2015-05-28 오후 10:14 8,086 20150102000000.apr
2015-05-28 오후 10:14 8,075 20150102060000.apr
2015-05-28 오후 10:15 8,080 20150102120000.apr
2015-05-28 오후 10:15 8,083 20150102180000.apr
2015-05-28 오후 10:15 8,080 20150103000000.apr
2015-05-28 오후 10:16 8,069 20150103060000.apr
2015-05-28 오후 10:16 8,080 20150103120000.apr
2015-05-28 오후 10:17 8,057 20150103180000.apr
2015-05-28 오후 10:17 8,076 20150104000000.apr
2015-05-28 오후 10:18 8,083 20150104060000.apr
2015-01-04 오전 09:04 8,099 20150104120000.apr
2015-01-05 오전 09:01 8,095 20150104180000.apr
2015-01-05 오전 09:02 8,091 20150105000000.apr
2015-01-05 오전 09:03 8,091 20150105060000.apr
2015-01-05 오전 09:04 8,091 20150105120000.apr
2015-01-06 오전 09:01 8,105 20150105180000.apr
2015-05-28 오후 10:18 8,078 20150106000000.apr
2015-05-28 오후 10:19 8,081 20150106060000.apr
2015-05-28 오후 10:19 8,084 20150106120000.apr
2015-05-28 오후 10:19 8,068 20150106180000.apr
2015-05-28 오후 10:20 8,072 20150107000000.apr
2015-01-07 오전 09:03 8,093 20150107060000.apr
2015-05-28 오후 10:20 8,067 20150107120000.apr
2015-05-28 오후 10:21 8,072 20150107180000.apr
2015-05-28 오후 10:21 8,076 20150108000000.apr
2015-05-28 오후 10:22 8,081 20150108060000.apr
2015-05-28 오후 10:22 8,079 20150108120000.apr
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2015-05-28 오후 10:23 8,082 20150109000000.apr
2015-05-28 오후 10:23 8,085 20150109060000.apr
2015-05-28 오후 10:24 8,068 20150109120000.apr
2015-05-28 오후 10:24 8,083 20150109180000.apr
2015-05-28 오후 10:25 8,076 20150110000000.apr
2015-05-28 오후 10:25 8,089 20150110060000.apr
2015-05-28 오후 10:25 8,080 20150110120000.apr
2015-05-28 오후 10:26 8,072 20150110180000.apr
2015-05-28 오후 10:26 8,074 20150111000000.apr
2015-05-28 오후 10:27 8,078 20150111060000.apr
2015-05-28 오후 10:27 8,081 20150111120000.apr
2015-05-28 오후 10:28 8,082 20150111180000.apr
2015-05-28 오후 10:28 8,086 20150112000000.apr
2015-05-28 오후 10:28 8,084 20150112060000.apr
2015-05-28 오후 10:29 8,061 20150112120000.apr
2015-05-28 오후 10:29 8,085 20150112180000.apr
2016-02-02 오전 03:11 20,462 20150113000000.apr
2016-02-02 오전 03:11 170 20150113000000.bln
2016-02-02 오전 03:11 277,326 20150113000000.DAT
2016-02-02 오전 03:11 38,620 20150113000000.INV
2016-02-02 오전 03:11 2,909 20150113000000.LOG
2016-02-02 오전 03:11 38,082 20150113000000.RES
2016-02-02 오전 03:11 126 20150113000000.RMS
2016-02-02 오전 03:11 21,689 20150113000000.THD
2015-05-28 오후 10:30 597 20150113060000.apr
2015-05-28 오후 10:30 8,080 20150113120000.apr
2015-05-28 오후 10:31 8,075 20150113180000.apr
2015-05-28 오후 10:31 8,074 20150114000000.apr
2015-05-28 오후 10:31 8,068 20150114060000.apr
2015-05-28 오후 10:32 8,073 20150114113011.apr
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1324개 파일 28,061,649 바이트
2개 디렉터리 45,008,695,296 바이트 남음
In [35]:
plot(Model)
Out[35]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x9fe1c88>]
In [36]:
mesh.plotSlice(Model, clim=(50., 200.))
Out[36]:
(<matplotlib.collections.QuadMesh at 0xe25a048>,)
In [ ]:
In [37]:
dzu = np.unique(dz)
In [38]:
def profile_time(i_n, color):
figsize(6,3)
ind = np.argwhere(dz == dzu[::-1][i_n])
nskip = 5
for i in range(0,ind.size,nskip):
plt.semilogy(DATA[ind.flatten()[i],:], color)
plt.tight_layout()
plt.ylim(50, 200)
In [39]:
colors = ['k', 'b', 'r', 'g']
inds = [0, 2, 4, 6]
for i, ind in enumerate(inds):
profile_time(ind,colors[i])
C:\Users\sungkeun\Anaconda2\lib\site-packages\matplotlib\scale.py:93: RuntimeWarning: invalid value encountered in less_equal
mask = a <= 0.0
In [40]:
profile_time(0, 'k')
In [41]:
profile_time(2, 'k')
In [42]:
profile_time(3, 'k')
In [43]:
profile_time(4, 'k')
In [44]:
profile_time(5, 'k')
In [45]:
profile_time(6, 'k')
In [46]:
profile_time(7, 'k')
In [ ]:
Content source: sgkang/DamGeophysics
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