In [28]:
import pandas as pd
import numpy as np
In [1]:
def PatternCount(text,pattern):
count = 0
for i in range(len(text)):
if text[i:i+len(pattern)] == pattern:
count += 1
return count
In [52]:
def FrequentWords(Text,k):
FrequentPatterns = []
Count = []
for i in range(len(Text) - k):
Pattern = Text[i:i+k]
Count.append(PatternCount(Text,Pattern))
print(str(Count[i]) + " ... " + Pattern)
maxCount = max(Count)
for i in range(len(Text) - k):
if Count[i]==maxCount:
FrequentPatterns.append(Text[i:i+k])
Set_FrequentPatterns = list(set(FrequentPatterns))
return Set_FrequentPatterns
In [54]:
result = FrequentWords("CCCTATGCCCTGGGCGCCTGGGCGCCCTATGCCCTGGGCGCCTGGGCGGGCTACGTGTGCTAGTAGGCTACGTGCCTGGGCGCCTGGGCGGGCTACGTGGCTACATCCCTATGCGCTACATTGCTAGTACCTGGGCGCCCTATGCCCCTATGCGGCTACGTGGGCTACGTGGCTACATTGCTAGTACCTGGGCGGCTACATTGCTAGTACCCTATGCTGCTAGTAGCTACATTGCTAGTACCCTATGCGGCTACGTGCCCTATGCGCTACATTGCTAGTATGCTAGTACCTGGGCGCCCTATGCCCCTATGCGGCTACGTGTGCTAGTACCCTATGCGGCTACGTGCCTGGGCGTGCTAGTACCCTATGCCCTGGGCGCCCTATGCCCCTATGCCCTGGGCGCCCTATGCTGCTAGTACCCTATGCTGCTAGTAGCTACATTGCTAGTATGCTAGTACCTGGGCGGGCTACGTGCCTGGGCGTGCTAGTAGCTACATTGCTAGTAGGCTACGTGCCCTATGCCCCTATGCCCCTATGCCCTGGGCGTGCTAGTATGCTAGTAGGCTACGTGGGCTACGTGGGCTACGTGTGCTAGTACCCTATGCGGCTACGTGCCCTATGCGCTACATCCCTATGCTGCTAGTATGCTAGTAGGCTACGTGCCTGGGCGCCTGGGCGCCTGGGCGGGCTACGTGTGCTAGTACCTGGGCGGGCTACGTGCCTGGGCGTGCTAGTATGCTAGTACCTGGGCGCCCTATGCGGCTACGTGCCTGGGCGCCCTATGCGCTACATTGCTAGTACCTGGGCG",13)
print(result)
5 ... CCCTATGCCCTGG
5 ... CCTATGCCCTGGG
5 ... CTATGCCCTGGGC
5 ... TATGCCCTGGGCG
4 ... ATGCCCTGGGCGC
4 ... TGCCCTGGGCGCC
2 ... GCCCTGGGCGCCT
2 ... CCCTGGGCGCCTG
5 ... CCTGGGCGCCTGG
5 ... CTGGGCGCCTGGG
5 ... TGGGCGCCTGGGC
5 ... GGGCGCCTGGGCG
2 ... GGCGCCTGGGCGC
2 ... GCGCCTGGGCGCC
1 ... CGCCTGGGCGCCC
2 ... GCCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
4 ... GGCGCCCTATGCC
4 ... GCGCCCTATGCCC
1 ... CGCCCTATGCCCT
1 ... GCCCTATGCCCTG
5 ... CCCTATGCCCTGG
5 ... CCTATGCCCTGGG
5 ... CTATGCCCTGGGC
5 ... TATGCCCTGGGCG
4 ... ATGCCCTGGGCGC
4 ... TGCCCTGGGCGCC
2 ... GCCCTGGGCGCCT
2 ... CCCTGGGCGCCTG
5 ... CCTGGGCGCCTGG
5 ... CTGGGCGCCTGGG
5 ... TGGGCGCCTGGGC
5 ... GGGCGCCTGGGCG
3 ... GGCGCCTGGGCGG
3 ... GCGCCTGGGCGGG
3 ... CGCCTGGGCGGGC
3 ... GCCTGGGCGGGCT
5 ... CCTGGGCGGGCTA
5 ... CTGGGCGGGCTAC
5 ... TGGGCGGGCTACG
5 ... GGGCGGGCTACGT
5 ... GGCGGGCTACGTG
2 ... GCGGGCTACGTGT
2 ... CGGGCTACGTGTG
3 ... GGGCTACGTGTGC
4 ... GGCTACGTGTGCT
4 ... GCTACGTGTGCTA
4 ... CTACGTGTGCTAG
4 ... TACGTGTGCTAGT
4 ... ACGTGTGCTAGTA
1 ... CGTGTGCTAGTAG
1 ... GTGTGCTAGTAGG
1 ... TGTGCTAGTAGGC
1 ... GTGCTAGTAGGCT
4 ... TGCTAGTAGGCTA
4 ... GCTAGTAGGCTAC
4 ... CTAGTAGGCTACG
4 ... TAGTAGGCTACGT
4 ... AGTAGGCTACGTG
3 ... GTAGGCTACGTGC
3 ... TAGGCTACGTGCC
2 ... AGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGC
3 ... GTGCCTGGGCGCC
2 ... TGCCTGGGCGCCT
3 ... GCCTGGGCGCCTG
5 ... CCTGGGCGCCTGG
5 ... CTGGGCGCCTGGG
5 ... TGGGCGCCTGGGC
5 ... GGGCGCCTGGGCG
3 ... GGCGCCTGGGCGG
3 ... GCGCCTGGGCGGG
3 ... CGCCTGGGCGGGC
3 ... GCCTGGGCGGGCT
5 ... CCTGGGCGGGCTA
5 ... CTGGGCGGGCTAC
5 ... TGGGCGGGCTACG
5 ... GGGCGGGCTACGT
5 ... GGCGGGCTACGTG
1 ... GCGGGCTACGTGG
1 ... CGGGCTACGTGGC
2 ... GGGCTACGTGGCT
2 ... GGCTACGTGGCTA
2 ... GCTACGTGGCTAC
2 ... CTACGTGGCTACA
2 ... TACGTGGCTACAT
1 ... ACGTGGCTACATC
1 ... CGTGGCTACATCC
1 ... GTGGCTACATCCC
1 ... TGGCTACATCCCT
1 ... GGCTACATCCCTA
2 ... GCTACATCCCTAT
2 ... CTACATCCCTATG
2 ... TACATCCCTATGC
1 ... ACATCCCTATGCG
1 ... CATCCCTATGCGC
1 ... ATCCCTATGCGCT
1 ... TCCCTATGCGCTA
4 ... CCCTATGCGCTAC
4 ... CCTATGCGCTACA
4 ... CTATGCGCTACAT
3 ... TATGCGCTACATT
3 ... ATGCGCTACATTG
3 ... TGCGCTACATTGC
3 ... GCGCTACATTGCT
3 ... CGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
5 ... ACATTGCTAGTAC
5 ... CATTGCTAGTACC
3 ... ATTGCTAGTACCT
3 ... TTGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGC
3 ... GTACCTGGGCGCC
3 ... TACCTGGGCGCCC
3 ... ACCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
4 ... GGCGCCCTATGCC
4 ... GCGCCCTATGCCC
3 ... CGCCCTATGCCCC
4 ... GCCCTATGCCCCT
5 ... CCCTATGCCCCTA
5 ... CCTATGCCCCTAT
5 ... CTATGCCCCTATG
5 ... TATGCCCCTATGC
2 ... ATGCCCCTATGCG
2 ... TGCCCCTATGCGG
2 ... GCCCCTATGCGGC
2 ... CCCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
1 ... TGCGGCTACGTGG
1 ... GCGGCTACGTGGG
1 ... CGGCTACGTGGGC
3 ... GGCTACGTGGGCT
3 ... GCTACGTGGGCTA
3 ... CTACGTGGGCTAC
3 ... TACGTGGGCTACG
3 ... ACGTGGGCTACGT
3 ... CGTGGGCTACGTG
2 ... GTGGGCTACGTGG
1 ... TGGGCTACGTGGC
2 ... GGGCTACGTGGCT
2 ... GGCTACGTGGCTA
2 ... GCTACGTGGCTAC
2 ... CTACGTGGCTACA
2 ... TACGTGGCTACAT
1 ... ACGTGGCTACATT
1 ... CGTGGCTACATTG
1 ... GTGGCTACATTGC
1 ... TGGCTACATTGCT
2 ... GGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
5 ... ACATTGCTAGTAC
5 ... CATTGCTAGTACC
3 ... ATTGCTAGTACCT
3 ... TTGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGG
1 ... GTACCTGGGCGGC
1 ... TACCTGGGCGGCT
1 ... ACCTGGGCGGCTA
1 ... CCTGGGCGGCTAC
1 ... CTGGGCGGCTACA
1 ... TGGGCGGCTACAT
1 ... GGGCGGCTACATT
1 ... GGCGGCTACATTG
1 ... GCGGCTACATTGC
1 ... CGGCTACATTGCT
2 ... GGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
5 ... ACATTGCTAGTAC
5 ... CATTGCTAGTACC
2 ... ATTGCTAGTACCC
2 ... TTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
2 ... AGTACCCTATGCT
2 ... GTACCCTATGCTG
2 ... TACCCTATGCTGC
2 ... ACCCTATGCTGCT
4 ... CCCTATGCTGCTA
4 ... CCTATGCTGCTAG
4 ... CTATGCTGCTAGT
4 ... TATGCTGCTAGTA
2 ... ATGCTGCTAGTAG
2 ... TGCTGCTAGTAGC
2 ... GCTGCTAGTAGCT
2 ... CTGCTAGTAGCTA
3 ... TGCTAGTAGCTAC
3 ... GCTAGTAGCTACA
3 ... CTAGTAGCTACAT
3 ... TAGTAGCTACATT
3 ... AGTAGCTACATTG
3 ... GTAGCTACATTGC
3 ... TAGCTACATTGCT
3 ... AGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
5 ... ACATTGCTAGTAC
5 ... CATTGCTAGTACC
2 ... ATTGCTAGTACCC
2 ... TTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
3 ... AGTACCCTATGCG
3 ... GTACCCTATGCGG
3 ... TACCCTATGCGGC
3 ... ACCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
4 ... TGCGGCTACGTGC
4 ... GCGGCTACGTGCC
2 ... CGGCTACGTGCCC
3 ... GGCTACGTGCCCT
3 ... GCTACGTGCCCTA
3 ... CTACGTGCCCTAT
3 ... TACGTGCCCTATG
3 ... ACGTGCCCTATGC
2 ... CGTGCCCTATGCG
2 ... GTGCCCTATGCGC
2 ... TGCCCTATGCGCT
3 ... GCCCTATGCGCTA
4 ... CCCTATGCGCTAC
4 ... CCTATGCGCTACA
4 ... CTATGCGCTACAT
3 ... TATGCGCTACATT
3 ... ATGCGCTACATTG
3 ... TGCGCTACATTGC
3 ... GCGCTACATTGCT
3 ... CGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
2 ... ACATTGCTAGTAT
2 ... CATTGCTAGTATG
2 ... ATTGCTAGTATGC
2 ... TTGCTAGTATGCT
5 ... TGCTAGTATGCTA
5 ... GCTAGTATGCTAG
5 ... CTAGTATGCTAGT
5 ... TAGTATGCTAGTA
3 ... AGTATGCTAGTAC
3 ... GTATGCTAGTACC
3 ... TATGCTAGTACCT
3 ... ATGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGC
3 ... GTACCTGGGCGCC
3 ... TACCTGGGCGCCC
3 ... ACCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
4 ... GGCGCCCTATGCC
4 ... GCGCCCTATGCCC
3 ... CGCCCTATGCCCC
4 ... GCCCTATGCCCCT
5 ... CCCTATGCCCCTA
5 ... CCTATGCCCCTAT
5 ... CTATGCCCCTATG
5 ... TATGCCCCTATGC
2 ... ATGCCCCTATGCG
2 ... TGCCCCTATGCGG
2 ... GCCCCTATGCGGC
2 ... CCCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
1 ... TGCGGCTACGTGT
1 ... GCGGCTACGTGTG
1 ... CGGCTACGTGTGC
4 ... GGCTACGTGTGCT
4 ... GCTACGTGTGCTA
4 ... CTACGTGTGCTAG
4 ... TACGTGTGCTAGT
4 ... ACGTGTGCTAGTA
3 ... CGTGTGCTAGTAC
3 ... GTGTGCTAGTACC
2 ... TGTGCTAGTACCC
3 ... GTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
3 ... AGTACCCTATGCG
3 ... GTACCCTATGCGG
3 ... TACCCTATGCGGC
3 ... ACCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
4 ... TGCGGCTACGTGC
4 ... GCGGCTACGTGCC
2 ... CGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGT
3 ... GTGCCTGGGCGTG
3 ... TGCCTGGGCGTGC
3 ... GCCTGGGCGTGCT
4 ... CCTGGGCGTGCTA
4 ... CTGGGCGTGCTAG
4 ... TGGGCGTGCTAGT
4 ... GGGCGTGCTAGTA
1 ... GGCGTGCTAGTAC
1 ... GCGTGCTAGTACC
1 ... CGTGCTAGTACCC
3 ... GTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
1 ... AGTACCCTATGCC
1 ... GTACCCTATGCCC
1 ... TACCCTATGCCCT
1 ... ACCCTATGCCCTG
5 ... CCCTATGCCCTGG
5 ... CCTATGCCCTGGG
5 ... CTATGCCCTGGGC
5 ... TATGCCCTGGGCG
4 ... ATGCCCTGGGCGC
4 ... TGCCCTGGGCGCC
2 ... GCCCTGGGCGCCC
2 ... CCCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
4 ... GGCGCCCTATGCC
4 ... GCGCCCTATGCCC
3 ... CGCCCTATGCCCC
4 ... GCCCTATGCCCCT
5 ... CCCTATGCCCCTA
5 ... CCTATGCCCCTAT
5 ... CTATGCCCCTATG
5 ... TATGCCCCTATGC
3 ... ATGCCCCTATGCC
3 ... TGCCCCTATGCCC
2 ... GCCCCTATGCCCT
2 ... CCCCTATGCCCTG
5 ... CCCTATGCCCTGG
5 ... CCTATGCCCTGGG
5 ... CTATGCCCTGGGC
5 ... TATGCCCTGGGCG
4 ... ATGCCCTGGGCGC
4 ... TGCCCTGGGCGCC
2 ... GCCCTGGGCGCCC
2 ... CCCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
1 ... GGCGCCCTATGCT
1 ... GCGCCCTATGCTG
1 ... CGCCCTATGCTGC
1 ... GCCCTATGCTGCT
4 ... CCCTATGCTGCTA
4 ... CCTATGCTGCTAG
4 ... CTATGCTGCTAGT
4 ... TATGCTGCTAGTA
1 ... ATGCTGCTAGTAC
1 ... TGCTGCTAGTACC
1 ... GCTGCTAGTACCC
1 ... CTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
2 ... AGTACCCTATGCT
2 ... GTACCCTATGCTG
2 ... TACCCTATGCTGC
2 ... ACCCTATGCTGCT
4 ... CCCTATGCTGCTA
4 ... CCTATGCTGCTAG
4 ... CTATGCTGCTAGT
4 ... TATGCTGCTAGTA
2 ... ATGCTGCTAGTAG
2 ... TGCTGCTAGTAGC
2 ... GCTGCTAGTAGCT
2 ... CTGCTAGTAGCTA
3 ... TGCTAGTAGCTAC
3 ... GCTAGTAGCTACA
3 ... CTAGTAGCTACAT
3 ... TAGTAGCTACATT
3 ... AGTAGCTACATTG
3 ... GTAGCTACATTGC
3 ... TAGCTACATTGCT
3 ... AGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
2 ... ACATTGCTAGTAT
2 ... CATTGCTAGTATG
2 ... ATTGCTAGTATGC
2 ... TTGCTAGTATGCT
5 ... TGCTAGTATGCTA
5 ... GCTAGTATGCTAG
5 ... CTAGTATGCTAGT
5 ... TAGTATGCTAGTA
3 ... AGTATGCTAGTAC
3 ... GTATGCTAGTACC
3 ... TATGCTAGTACCT
3 ... ATGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGG
2 ... GTACCTGGGCGGG
2 ... TACCTGGGCGGGC
2 ... ACCTGGGCGGGCT
5 ... CCTGGGCGGGCTA
5 ... CTGGGCGGGCTAC
5 ... TGGGCGGGCTACG
5 ... GGGCGGGCTACGT
5 ... GGCGGGCTACGTG
2 ... GCGGGCTACGTGC
2 ... CGGGCTACGTGCC
2 ... GGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGT
3 ... GTGCCTGGGCGTG
3 ... TGCCTGGGCGTGC
3 ... GCCTGGGCGTGCT
4 ... CCTGGGCGTGCTA
4 ... CTGGGCGTGCTAG
4 ... TGGGCGTGCTAGT
4 ... GGGCGTGCTAGTA
1 ... GGCGTGCTAGTAG
1 ... GCGTGCTAGTAGC
1 ... CGTGCTAGTAGCT
1 ... GTGCTAGTAGCTA
3 ... TGCTAGTAGCTAC
3 ... GCTAGTAGCTACA
3 ... CTAGTAGCTACAT
3 ... TAGTAGCTACATT
3 ... AGTAGCTACATTG
3 ... GTAGCTACATTGC
3 ... TAGCTACATTGCT
3 ... AGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
1 ... ACATTGCTAGTAG
1 ... CATTGCTAGTAGG
1 ... ATTGCTAGTAGGC
1 ... TTGCTAGTAGGCT
4 ... TGCTAGTAGGCTA
4 ... GCTAGTAGGCTAC
4 ... CTAGTAGGCTACG
4 ... TAGTAGGCTACGT
4 ... AGTAGGCTACGTG
3 ... GTAGGCTACGTGC
3 ... TAGGCTACGTGCC
1 ... AGGCTACGTGCCC
3 ... GGCTACGTGCCCT
3 ... GCTACGTGCCCTA
3 ... CTACGTGCCCTAT
3 ... TACGTGCCCTATG
3 ... ACGTGCCCTATGC
1 ... CGTGCCCTATGCC
1 ... GTGCCCTATGCCC
1 ... TGCCCTATGCCCC
4 ... GCCCTATGCCCCT
5 ... CCCTATGCCCCTA
5 ... CCTATGCCCCTAT
5 ... CTATGCCCCTATG
5 ... TATGCCCCTATGC
3 ... ATGCCCCTATGCC
3 ... TGCCCCTATGCCC
1 ... GCCCCTATGCCCC
1 ... CCCCTATGCCCCT
5 ... CCCTATGCCCCTA
5 ... CCTATGCCCCTAT
5 ... CTATGCCCCTATG
5 ... TATGCCCCTATGC
3 ... ATGCCCCTATGCC
3 ... TGCCCCTATGCCC
2 ... GCCCCTATGCCCT
2 ... CCCCTATGCCCTG
5 ... CCCTATGCCCTGG
5 ... CCTATGCCCTGGG
5 ... CTATGCCCTGGGC
5 ... TATGCCCTGGGCG
1 ... ATGCCCTGGGCGT
1 ... TGCCCTGGGCGTG
1 ... GCCCTGGGCGTGC
1 ... CCCTGGGCGTGCT
4 ... CCTGGGCGTGCTA
4 ... CTGGGCGTGCTAG
4 ... TGGGCGTGCTAGT
4 ... GGGCGTGCTAGTA
2 ... GGCGTGCTAGTAT
2 ... GCGTGCTAGTATG
2 ... CGTGCTAGTATGC
2 ... GTGCTAGTATGCT
5 ... TGCTAGTATGCTA
5 ... GCTAGTATGCTAG
5 ... CTAGTATGCTAGT
5 ... TAGTATGCTAGTA
2 ... AGTATGCTAGTAG
2 ... GTATGCTAGTAGG
2 ... TATGCTAGTAGGC
2 ... ATGCTAGTAGGCT
4 ... TGCTAGTAGGCTA
4 ... GCTAGTAGGCTAC
4 ... CTAGTAGGCTACG
4 ... TAGTAGGCTACGT
4 ... AGTAGGCTACGTG
1 ... GTAGGCTACGTGG
1 ... TAGGCTACGTGGG
1 ... AGGCTACGTGGGC
3 ... GGCTACGTGGGCT
3 ... GCTACGTGGGCTA
3 ... CTACGTGGGCTAC
3 ... TACGTGGGCTACG
3 ... ACGTGGGCTACGT
3 ... CGTGGGCTACGTG
2 ... GTGGGCTACGTGG
1 ... TGGGCTACGTGGG
1 ... GGGCTACGTGGGC
3 ... GGCTACGTGGGCT
3 ... GCTACGTGGGCTA
3 ... CTACGTGGGCTAC
3 ... TACGTGGGCTACG
3 ... ACGTGGGCTACGT
3 ... CGTGGGCTACGTG
1 ... GTGGGCTACGTGT
1 ... TGGGCTACGTGTG
3 ... GGGCTACGTGTGC
4 ... GGCTACGTGTGCT
4 ... GCTACGTGTGCTA
4 ... CTACGTGTGCTAG
4 ... TACGTGTGCTAGT
4 ... ACGTGTGCTAGTA
3 ... CGTGTGCTAGTAC
3 ... GTGTGCTAGTACC
2 ... TGTGCTAGTACCC
3 ... GTGCTAGTACCCT
6 ... TGCTAGTACCCTA
6 ... GCTAGTACCCTAT
6 ... CTAGTACCCTATG
6 ... TAGTACCCTATGC
3 ... AGTACCCTATGCG
3 ... GTACCCTATGCGG
3 ... TACCCTATGCGGC
3 ... ACCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
4 ... TGCGGCTACGTGC
4 ... GCGGCTACGTGCC
2 ... CGGCTACGTGCCC
3 ... GGCTACGTGCCCT
3 ... GCTACGTGCCCTA
3 ... CTACGTGCCCTAT
3 ... TACGTGCCCTATG
3 ... ACGTGCCCTATGC
2 ... CGTGCCCTATGCG
2 ... GTGCCCTATGCGC
2 ... TGCCCTATGCGCT
3 ... GCCCTATGCGCTA
4 ... CCCTATGCGCTAC
4 ... CCTATGCGCTACA
4 ... CTATGCGCTACAT
1 ... TATGCGCTACATC
1 ... ATGCGCTACATCC
1 ... TGCGCTACATCCC
1 ... GCGCTACATCCCT
1 ... CGCTACATCCCTA
2 ... GCTACATCCCTAT
2 ... CTACATCCCTATG
2 ... TACATCCCTATGC
1 ... ACATCCCTATGCT
1 ... CATCCCTATGCTG
1 ... ATCCCTATGCTGC
1 ... TCCCTATGCTGCT
4 ... CCCTATGCTGCTA
4 ... CCTATGCTGCTAG
4 ... CTATGCTGCTAGT
4 ... TATGCTGCTAGTA
1 ... ATGCTGCTAGTAT
1 ... TGCTGCTAGTATG
1 ... GCTGCTAGTATGC
1 ... CTGCTAGTATGCT
5 ... TGCTAGTATGCTA
5 ... GCTAGTATGCTAG
5 ... CTAGTATGCTAGT
5 ... TAGTATGCTAGTA
2 ... AGTATGCTAGTAG
2 ... GTATGCTAGTAGG
2 ... TATGCTAGTAGGC
2 ... ATGCTAGTAGGCT
4 ... TGCTAGTAGGCTA
4 ... GCTAGTAGGCTAC
4 ... CTAGTAGGCTACG
4 ... TAGTAGGCTACGT
4 ... AGTAGGCTACGTG
3 ... GTAGGCTACGTGC
3 ... TAGGCTACGTGCC
2 ... AGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGC
3 ... GTGCCTGGGCGCC
2 ... TGCCTGGGCGCCT
3 ... GCCTGGGCGCCTG
5 ... CCTGGGCGCCTGG
5 ... CTGGGCGCCTGGG
5 ... TGGGCGCCTGGGC
5 ... GGGCGCCTGGGCG
2 ... GGCGCCTGGGCGC
2 ... GCGCCTGGGCGCC
1 ... CGCCTGGGCGCCT
3 ... GCCTGGGCGCCTG
5 ... CCTGGGCGCCTGG
5 ... CTGGGCGCCTGGG
5 ... TGGGCGCCTGGGC
5 ... GGGCGCCTGGGCG
3 ... GGCGCCTGGGCGG
3 ... GCGCCTGGGCGGG
3 ... CGCCTGGGCGGGC
3 ... GCCTGGGCGGGCT
5 ... CCTGGGCGGGCTA
5 ... CTGGGCGGGCTAC
5 ... TGGGCGGGCTACG
5 ... GGGCGGGCTACGT
5 ... GGCGGGCTACGTG
2 ... GCGGGCTACGTGT
2 ... CGGGCTACGTGTG
3 ... GGGCTACGTGTGC
4 ... GGCTACGTGTGCT
4 ... GCTACGTGTGCTA
4 ... CTACGTGTGCTAG
4 ... TACGTGTGCTAGT
4 ... ACGTGTGCTAGTA
3 ... CGTGTGCTAGTAC
3 ... GTGTGCTAGTACC
1 ... TGTGCTAGTACCT
1 ... GTGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGG
2 ... GTACCTGGGCGGG
2 ... TACCTGGGCGGGC
2 ... ACCTGGGCGGGCT
5 ... CCTGGGCGGGCTA
5 ... CTGGGCGGGCTAC
5 ... TGGGCGGGCTACG
5 ... GGGCGGGCTACGT
5 ... GGCGGGCTACGTG
2 ... GCGGGCTACGTGC
2 ... CGGGCTACGTGCC
2 ... GGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGT
3 ... GTGCCTGGGCGTG
3 ... TGCCTGGGCGTGC
3 ... GCCTGGGCGTGCT
4 ... CCTGGGCGTGCTA
4 ... CTGGGCGTGCTAG
4 ... TGGGCGTGCTAGT
4 ... GGGCGTGCTAGTA
2 ... GGCGTGCTAGTAT
2 ... GCGTGCTAGTATG
2 ... CGTGCTAGTATGC
2 ... GTGCTAGTATGCT
5 ... TGCTAGTATGCTA
5 ... GCTAGTATGCTAG
5 ... CTAGTATGCTAGT
5 ... TAGTATGCTAGTA
3 ... AGTATGCTAGTAC
3 ... GTATGCTAGTACC
3 ... TATGCTAGTACCT
3 ... ATGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
7 ... TAGTACCTGGGCG
3 ... AGTACCTGGGCGC
3 ... GTACCTGGGCGCC
3 ... TACCTGGGCGCCC
3 ... ACCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
2 ... GGCGCCCTATGCG
1 ... GCGCCCTATGCGG
1 ... CGCCCTATGCGGC
1 ... GCCCTATGCGGCT
6 ... CCCTATGCGGCTA
6 ... CCTATGCGGCTAC
6 ... CTATGCGGCTACG
6 ... TATGCGGCTACGT
6 ... ATGCGGCTACGTG
4 ... TGCGGCTACGTGC
4 ... GCGGCTACGTGCC
2 ... CGGCTACGTGCCT
6 ... GGCTACGTGCCTG
6 ... GCTACGTGCCTGG
6 ... CTACGTGCCTGGG
6 ... TACGTGCCTGGGC
6 ... ACGTGCCTGGGCG
3 ... CGTGCCTGGGCGC
3 ... GTGCCTGGGCGCC
1 ... TGCCTGGGCGCCC
2 ... GCCTGGGCGCCCT
7 ... CCTGGGCGCCCTA
7 ... CTGGGCGCCCTAT
7 ... TGGGCGCCCTATG
7 ... GGGCGCCCTATGC
2 ... GGCGCCCTATGCG
1 ... GCGCCCTATGCGC
1 ... CGCCCTATGCGCT
3 ... GCCCTATGCGCTA
4 ... CCCTATGCGCTAC
4 ... CCTATGCGCTACA
4 ... CTATGCGCTACAT
3 ... TATGCGCTACATT
3 ... ATGCGCTACATTG
3 ... TGCGCTACATTGC
3 ... GCGCTACATTGCT
3 ... CGCTACATTGCTA
8 ... GCTACATTGCTAG
8 ... CTACATTGCTAGT
8 ... TACATTGCTAGTA
5 ... ACATTGCTAGTAC
5 ... CATTGCTAGTACC
3 ... ATTGCTAGTACCT
3 ... TTGCTAGTACCTG
7 ... TGCTAGTACCTGG
7 ... GCTAGTACCTGGG
7 ... CTAGTACCTGGGC
['CTACATTGCTAGT', 'GCTACATTGCTAG', 'TACATTGCTAGTA']
Content source: lfunderburk/BioinformaticsTraining
Similar notebooks: