Merging, Joining, and Concatenating

There are 3 main ways of combining DataFrames together: Merging, Joining and Concatenating. In this lecture we will discuss these 3 methods with examples.

Example DataFrames



In [3]:

    
import pandas as pd



In [4]:

    
df1 = pd.DataFrame({'A': ['A0', 'A1', 'A2', 'A3'],
                        'B': ['B0', 'B1', 'B2', 'B3'],
                        'C': ['C0', 'C1', 'C2', 'C3'],
                        'D': ['D0', 'D1', 'D2', 'D3']},
                        index=[0, 1, 2, 3])



In [5]:

    
df2 = pd.DataFrame({'A': ['A4', 'A5', 'A6', 'A7'],
                        'B': ['B4', 'B5', 'B6', 'B7'],
                        'C': ['C4', 'C5', 'C6', 'C7'],
                        'D': ['D4', 'D5', 'D6', 'D7']},
                         index=[4, 5, 6, 7])



In [6]:

    
df3 = pd.DataFrame({'A': ['A8', 'A9', 'A10', 'A11'],
                        'B': ['B8', 'B9', 'B10', 'B11'],
                        'C': ['C8', 'C9', 'C10', 'C11'],
                        'D': ['D8', 'D9', 'D10', 'D11']},
                        index=[8, 9, 10, 11])



In [7]:

    
df1



In [8]:

    
df2



In [12]:

    
df3

Concatenation

Concatenation basically glues together DataFrames. Keep in mind that dimensions should match along the axis you are concatenating on. You can use pd.concat and pass in a list of DataFrames to concatenate together:



In [10]:

    
pd.concat([df1,df2,df3])



In [18]:

    
pd.concat([df1,df2,df3],axis=1)









    Out[18]:






  
    
      
      A
      B
      C
      D
      A
      B
      C
      D
      A
      B
      C
      D
    
  
  
    
      0
      A0
      B0
      C0
      D0
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      1
      A1
      B1
      C1
      D1
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      2
      A2
      B2
      C2
      D2
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      3
      A3
      B3
      C3
      D3
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      4
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A4
      B4
      C4
      D4
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      5
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A5
      B5
      C5
      D5
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      6
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A6
      B6
      C6
      D6
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      7
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A7
      B7
      C7
      D7
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
    
    
      8
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A8
      B8
      C8
      D8
    
    
      9
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A9
      B9
      C9
      D9
    
    
      10
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A10
      B10
      C10
      D10
    
    
      11
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      NaN
      A11
      B11
      C11
      D11

Example DataFrames



In [28]:

    
left = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1', 'K2', 'K3'],
                     'A': ['A0', 'A1', 'A2', 'A3'],
                     'B': ['B0', 'B1', 'B2', 'B3']})
   
right = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1', 'K2', 'K3'],
                          'C': ['C0', 'C1', 'C2', 'C3'],
                          'D': ['D0', 'D1', 'D2', 'D3']})



In [29]:

    
left



In [30]:

    
right

Merging

The merge function allows you to merge DataFrames together using a similar logic as merging SQL Tables together. For example:



In [35]:

    
pd.merge(left,right,how='inner',on='key')

Or to show a more complicated example:



In [37]:

    
left = pd.DataFrame({'key1': ['K0', 'K0', 'K1', 'K2'],
                     'key2': ['K0', 'K1', 'K0', 'K1'],
                        'A': ['A0', 'A1', 'A2', 'A3'],
                        'B': ['B0', 'B1', 'B2', 'B3']})
    
right = pd.DataFrame({'key1': ['K0', 'K1', 'K1', 'K2'],
                               'key2': ['K0', 'K0', 'K0', 'K0'],
                                  'C': ['C0', 'C1', 'C2', 'C3'],
                                  'D': ['D0', 'D1', 'D2', 'D3']})



In [39]:

    
pd.merge(left, right, on=['key1', 'key2'])



In [40]:

    
pd.merge(left, right, how='outer', on=['key1', 'key2'])



In [41]:

    
pd.merge(left, right, how='right', on=['key1', 'key2'])



In [42]:

    
pd.merge(left, right, how='left', on=['key1', 'key2'])

Joining

Joining is a convenient method for combining the columns of two potentially differently-indexed DataFrames into a single result DataFrame.



In [46]:

    
left = pd.DataFrame({'A': ['A0', 'A1', 'A2'],
                     'B': ['B0', 'B1', 'B2']},
                      index=['K0', 'K1', 'K2']) 

right = pd.DataFrame({'C': ['C0', 'C2', 'C3'],
                    'D': ['D0', 'D2', 'D3']},
                      index=['K0', 'K2', 'K3'])



In [47]:

    
left.join(right)



In [48]:

    
left.join(right, how='outer')

	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0
1	A1	B1	C1	D1
2	A2	B2	C2	D2
3	A3	B3	C3	D3
4	A4	B4	C4	D4
5	A5	B5	C5	D5
6	A6	B6	C6	D6
7	A7	B7	C7	D7
8	A8	B8	C8	D8
9	A9	B9	C9	D9
10	A10	B10	C10	D10
11	A11	B11	C11	D11

	A	B	C	D	A	B	C	D	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
1	A1	B1	C1	D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	A2	B2	C2	D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	A3	B3	C3	D3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaN	NaN	NaN	NaN	A4	B4	C4	D4	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaN	NaN	NaN	NaN	A5	B5	C5	D5	NaN	NaN	NaN	NaN
6	NaN	NaN	NaN	NaN	A6	B6	C6	D6	NaN	NaN	NaN	NaN
7	NaN	NaN	NaN	NaN	A7	B7	C7	D7	NaN	NaN	NaN	NaN
8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A8	B8	C8	D8
9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A9	B9	C9	D9
10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A10	B10	C10	D10
11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A11	B11	C11	D11

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN
5	NaN	NaN	K2	K0	C3	D3

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN

	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0
1	A1	B1	C1	D1
2	A2	B2	C2	D2
3	A3	B3	C3	D3
4	A4	B4	C4	D4
5	A5	B5	C5	D5
6	A6	B6	C6	D6
7	A7	B7	C7	D7
8	A8	B8	C8	D8
9	A9	B9	C9	D9
10	A10	B10	C10	D10
11	A11	B11	C11	D11

	A	B	C	D	A	B	C	D	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
1	A1	B1	C1	D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	A2	B2	C2	D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	A3	B3	C3	D3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaN	NaN	NaN	NaN	A4	B4	C4	D4	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaN	NaN	NaN	NaN	A5	B5	C5	D5	NaN	NaN	NaN	NaN
6	NaN	NaN	NaN	NaN	A6	B6	C6	D6	NaN	NaN	NaN	NaN
7	NaN	NaN	NaN	NaN	A7	B7	C7	D7	NaN	NaN	NaN	NaN
8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A8	B8	C8	D8
9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A9	B9	C9	D9
10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A10	B10	C10	D10
11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A11	B11	C11	D11

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN
5	NaN	NaN	K2	K0	C3	D3

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN

Merging, Joining, and Concatenating

Example DataFrames

Concatenation

Example DataFrames

Merging

Joining

Great Job!

	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0
1	A1	B1	C1	D1
2	A2	B2	C2	D2
3	A3	B3	C3	D3
4	A4	B4	C4	D4
5	A5	B5	C5	D5
6	A6	B6	C6	D6
7	A7	B7	C7	D7
8	A8	B8	C8	D8
9	A9	B9	C9	D9
10	A10	B10	C10	D10
11	A11	B11	C11	D11

	A	B	C	D	A	B	C	D	A	B	C	D
0	A0	B0	C0	D0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
1	A1	B1	C1	D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
2	A2	B2	C2	D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
3	A3	B3	C3	D3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaN	NaN	NaN	NaN	A4	B4	C4	D4	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaN	NaN	NaN	NaN	A5	B5	C5	D5	NaN	NaN	NaN	NaN
6	NaN	NaN	NaN	NaN	A6	B6	C6	D6	NaN	NaN	NaN	NaN
7	NaN	NaN	NaN	NaN	A7	B7	C7	D7	NaN	NaN	NaN	NaN
8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A8	B8	C8	D8
9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A9	B9	C9	D9
10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A10	B10	C10	D10
11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	A11	B11	C11	D11

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN
5	NaN	NaN	K2	K0	C3	D3

	A	B	key1	key2	C	D
0	A0	B0	K0	K0	C0	D0
1	A1	B1	K0	K1	NaN	NaN
2	A2	B2	K1	K0	C1	D1
3	A2	B2	K1	K0	C2	D2
4	A3	B3	K2	K1	NaN	NaN