In [ ]:

    

# Reload when code changed:
%load_ext autoreload
%autoreload 2
%pwd


    

In [ ]:

    

import sys
path = "../w_github_sharkdata/proj_sharkdata/proj_sharkdata/sharkdata_core/dwca_generator"
sys.path.append(path)


    

In [ ]:

    

%matplotlib inline
import pandas as pd
import numpy as np
import dwca_generator


    

In [ ]:

    




    

In [ ]:

    

dwca = dwca_generator.DarwinCoreArchiveGenerator('Bacterioplankton')
dwca.add_data('test_data/shark_data.txt')
dwca.add_metadata('test_data/shark_metadata.txt')


    

In [ ]:

    

print('Length: ' + str(len(dwca._data_df)))
dwca._data_df


    

In [ ]:

    

dwca._data_df.info()


    

In [ ]:

    

print(len(dwca._data_df.shark_sample_id_md5.value_counts()))
print(dwca._data_df.shark_sample_id_md5.value_counts().max())
print(dwca._data_df.shark_sample_id_md5.value_counts().min())


    

In [ ]:

    

dwca.create_dwca_file()


    

In [ ]:

    

dwca._metadata_dict


    

In [ ]:

    




    

In [ ]:

    

#dwca._data_df.value.plot()


    

In [ ]:

    

#dwca._data_df.value.max()


    

In [ ]:

    

#dwca._data_df.parameter.unique()


    

In [ ]: